La investigación ha descubierto que el aprendizaje automático puede predecir cepas de bacterias que probablemente causen brotes de intoxicación alimentaria.
El estudio, que se centró en las cepas nocivas de la bacteria E. coli, podría ayudar a los funcionarios de salud pública a dirigir las intervenciones y reducir el riesgo para la salud humana.
Investigadores del Instituto Roslin de la Universidad de Edimburgo utilizaron un software que compara la información genética de muestras bacterianas aisladas de animales y personas.
intoxicación alimentaria
El software aprende las firmas de ADN que están asociadas con muestras de E. coli que han causado brotes de infección en personas.
Luego puede seleccionar las cepas de animales que tienen estas firmas, que por lo tanto probablemente sean una amenaza para la salud humana.
cepas mortales
La mayoría de las cepas de E. coli viven en las tripas de personas y animales sin causar enfermedades, pero E. coli O157 está relacionada con infecciones humanas más graves.
Las vacas también transportan E. coli O157 y sirven como reservorio principal de estas bacterias tóxicas. Los animales excretan la bacteria en sus heces pero no se enferman. Esto hace que sea difícil detectar qué rebaños y animales llevan cepas que son probablescausar enfermedad en las personas.
firmas de ADN
El equipo capacitó al software en secuencias de ADN de cepas aisladas de rebaños de ganado e infecciones humanas en el Reino Unido y los EE. UU.
Una vez entrenada, la computadora puede predecir si es probable que una cepa de E. coli provenga de una vaca o una persona.
enfermedad humana
Usando este enfoque, el equipo predice que menos del diez por ciento de las cepas de ganado E. coli O157 es probable que tengan el potencial de causar enfermedades humanas.
Las intervenciones para detener la propagación de la enfermedad, como las vacunas, podrían dirigirse a los rebaños con estas cepas para minimizar el riesgo de brotes en las personas, dice el equipo.
"Nuestros hallazgos indican que las cepas de E. coli O157 más peligrosas de hecho pueden ser muy raras en el reservorio de ganado, lo que es tranquilizador. El estudio destaca el potencial de los enfoques de aprendizaje automático para identificar estas cepas temprano y prevenir brotes de esta infecciónenfermedad ", dijo el profesor David Gally del Instituto Roslin, Universidad de Edimburgo .
E. coli 0157
E. coli O157 causa calambres estomacales, vómitos y diarrea severa en personas infectadas. Un brote reciente de la enfermedad en Escocia resultó en la muerte de un niño y otros 19 casos de intoxicación alimentaria grave. Se cree que la infección se originóde una fuente de queso no pasteurizada.
Nuevo enfoque
Los investigadores dicen que su enfoque podría adaptarse para analizar muestras de otros tipos de bacterias aisladas de animales, como salmonella y campylobacter, para identificar cepas con el potencial de causar enfermedades humanas.
El estudio, financiado por Food Standards Scotland y la Food Standards Agency, se publica en el Actas de la Academia Nacional de Ciencias .
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Materiales proporcionado por Universidad de Edimburgo . Nota: El contenido puede ser editado por estilo y longitud.
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