Todos hemos sufrido de virus, pero ¿sabía que también son un problema para los hongos y el moho? Los micovirus son virus que infectan específicamente a los hongos y tienen el potencial de afectar la ecología, la agricultura, la seguridad alimentaria y la salud pública. Comprensiónla naturaleza de estos virus, incluido su número y evolución, puede ayudarnos a comprender sus orígenes e informar nuestra comprensión de los virus en general.
Investigaciones anteriores sobre micovirus de ARN se han basado en la similitud de su secuencia con los virus que ya se han descrito. Sin embargo, este enfoque deja a los virus con diferentes estructuras o secuencias genéticas sin descubrir. Usando un enfoque tecnológico avanzado llamado secuenciación de ARN bicatenario fragmentado y ligado con cebador,o FLDS para abreviar, los investigadores de la Universidad de Tsukuba pudieron identificar secuencias virales que anteriormente se pasaron por alto.
Resumiendo la importancia de este trabajo, el profesor Hagiwara dijo: "Los enfoques actuales utilizados para identificar los virus de ARN significan que se ha subestimado su diversidad genética. Con FLDS, pudimos estudiar los virus de ARN sin depender de la similitud de secuencia, lo que nos permitepara identificar secuencias virales de ARN diferentes a las identificadas previamente ".
Utilizando FLDS, los profesores Urayama y Hagiwara, y sus colegas, identificaron 19 virus de ARN en un hongo llamado Aspergillus. Destacando el valor de este enfoque, 9 de los 19 virus identificados no habían sido detectados usando métodos convencionales de examen. Además, el 42%de los virus identificados tenían genomas segmentados o diseminados por todo el genoma del huésped, y otros identificados tenían arquitecturas genómicas novedosas
La ARN polimerasa dependiente de ARN RdRp es un gen esencial que se encuentra en todos los virus de ARN y permite la replicación del genoma de ARN a partir de una plantilla de ARN. Se entendía comúnmente que todos los virus de ARN codifican RdRp como un único gen continuo.
"Inesperadamente, encontramos que los virus dentro de un cierto clado de Narnaviridae codifican un gen RdRp que carece de dominios catalíticos", explica el profesor Urayama, "pero también encontramos un marco de lectura abierto diferente que contiene los dominios faltantes". Aunque algunas secuencias RdRp carecen deLos dominios catalíticos se han descrito anteriormente, esos genomas virales también carecen de los dominios catalíticos y producen proteínas RdRp imperfectas. La RdRp funcional, aunque dividida, descrita por los profesores Urayama y Hagiwara, y sus colegas, indica que los investigadores deberían reconsiderar la plasticidad estructural de RdRp.
Fuente de la historia :
Materiales proporcionado por Universidad de Tsukuba . Nota: el contenido se puede editar por estilo y longitud.
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