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Alineamiento estructural genómica

La alineación estructural es una forma de alineación de secuencia basada en la comparación de la forma.

Estas alineaciones intentan establecer equivalencias entre dos o más estructuras de polímero en función de su forma y conformación tridimensional.

Este proceso generalmente se aplica a estructuras terciarias de proteínas, pero también se puede usar para moléculas de ARN grandes.

En contraste con la superposición estructural simple, donde se conocen al menos algunos residuos equivalentes de las dos estructuras, la alineación estructural no requiere conocimiento a priori de posiciones equivalentes.

La alineación estructural es una herramienta valiosa para la comparación de proteínas con baja similitud de secuencia, donde las relaciones evolutivas entre proteínas no pueden detectarse fácilmente mediante técnicas de alineación de secuencia estándar.

Por lo tanto, la alineación estructural puede usarse para implicar relaciones evolutivas entre proteínas que comparten muy poca secuencia común.

Nota : El texto anterior está extraído del artículo de Wikipedia " Alineamiento estructural genómica ", que se ha publicado bajo el Licencia de documentación libre de GNU .
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