El olivo fue uno de los primeros árboles en ser domesticado en la historia de la humanidad, probablemente hace unos 6,000 años. Un emblema mediterráneo por excelencia, es de vital importancia para las economías españolas y otras economías regionales Italia, Grecia y PortugalDe hecho, España es el principal productor de aceite de oliva en el mundo. Cada año, se producen casi tres millones de toneladas de aceite, para consumo local y exportación. España produce un tercio de este total.
Sin embargo, hasta ahora, el genoma del olivo era desconocido. El genoma regula factores tales como las diferencias entre variedades, tamaños y sabor de las aceitunas, por qué los árboles viven tanto o las razones de su adaptación a la agricultura de secano.
Ahora, un equipo de investigadores del Centro de Regulación Genómica CRG en Barcelona, el Real Jardín Botánico CSIC-RJB y el Centro Nacional de Análisis Genómico CNAG-CRG, ha aportado una nueva visión al rompecabezas genético deEl olivo, al secuenciar el genoma completo de esta especie por primera vez, los resultados de este trabajo, totalmente financiado por Banco Santander, se han publicado esta semana en la revista Open Access y Open Data. GigaScience . El artículo allanará el camino hacia nuevos trabajos de investigación que ayudarán a los olivos en su desarrollo y los protegerán de infecciones que ahora causan daños importantes, como los ataques de bacterias Xilella fastidiosa y hongos Verticillium dhailae.
"Sin lugar a dudas, es un árbol emblemático, y es muy difícil mejorar el fitomejoramiento, ya que hay que esperar al menos 12 años para ver qué características morfológicas tendrá y si es aconsejable cruzarlo.", dice el autor principal de este artículo, Toni Gabaldón, profesor de investigación ICREA y jefe del laboratorio de genómica comparativa en el CRG." Conocer la información genética del olivo nos permitirá contribuir a la mejora de la producción de aceite y oliva, de gran relevancia.a la economía española ", agrega.
Financiación privada para apoyar la ciencia pública
La historia de este proyecto comienza con una presentación, una coincidencia y un desafío. Hace cuatro años, Gabaldón trabajó con Pablo Vargas, investigador del CSIC en el Real Jardín Botánico, en la presentación de resultados científicos de proyectos centrados en especies en peligro de extinción,como el lince ibérico, que había sido financiado por Banco Santander.
En ese momento, Banco Santander había expresado un gran interés en financiar proyectos científicos en España. En el transcurso de la presentación, Pablo Vargas propuso a Emilio Botín la secuenciación completa del genoma del olivo, utilizando la misma tecnología que se había utilizado parasecuenciar el lince; en otras palabras, la estrategia tecnológica más avanzada para lograr un genoma de alta calidad.
Cinco meses después de esa reunión, se firmó un contrato para llevar a cabo la primera secuencia completa del ADN del olivo, un esfuerzo de investigación de tres años coordinado por Pablo Vargas.
"Hay tres fases para la secuenciación del genoma: primero, aislar todos los genes, que publicamos hace dos años. Segundo, ensamblar el genoma, que consiste en ordenar esos genes uno tras otro, como unir frases sueltasen un libro. Por último, identifique todos los genes o unir el libro. Las últimas dos fases son lo que hemos hecho y ahora estamos presentando ", dice el investigador del CSIC Real Jardín Botánico.
Para continuar con la analogía del libro, según Tyler Alioto del CNAG-CRG "este genoma ha generado alrededor de 1,31 billones de letras y más de 1,000 GBytes de datos. Estamos sorprendidos porque hemos detectado más de 56,000 genes, significativamente más que esosdetectado en genomas secuenciados de plantas relacionadas, y el doble que el genoma humano ".
Decodificando su historia evolutiva
Además de la secuenciación completa del genoma del olivo, los investigadores también han comparado el ADN de este árbol milenario con otras variedades como el olivo silvestre. También han encontrado el transcriptoma, los genes expresados para determinar quéexisten diferencias en el nivel de expresión genética en hojas, raíces y frutos en diferentes etapas de maduración.
El siguiente paso, dicen los investigadores, será decodificar la historia evolutiva de este árbol, que ha formado parte de las civilizaciones del viejo mundo desde la Edad del Bronce. En ese momento, en el Mediterráneo oriental, el proceso de domesticación de olivos silvestreseso dio origen a los árboles de hoy. Más tarde, los procesos de selección en diferentes países mediterráneos dieron lugar a las casi 1,000 variedades de árboles que tenemos hoy.
Conocer la evolución de los olivos de diferentes países permitirá conocer sus orígenes y descubrir las claves que le han permitido adaptarse a condiciones ambientales muy diversas. También ayudará a descubrir las razones detrás de su extraordinaria longevidad, como los árbolespuede vivir de 3,000 a 4,000 años.
"Esa longevidad hace que el olivo que hemos secuenciado sea prácticamente un monumento vivo", dice Gabaldón. "Hasta ahora, todos los individuos secuenciados, desde la mosca de la fruta Drosophila melanogaster hasta el primer ser humano analizado, han vivido paracierto tiempo, dependiendo de su esperanza de vida, pero luego muere o morirá. Esta es la primera vez que se secuencia el ADN de un individuo mayor de 1,000 años, y que probablemente vivirá otros 1,000 años ", dicen Gabaldón yVargas.
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Materiales proporcionado por Centro de Regulación Genómica . Nota: El contenido puede ser editado por estilo y longitud.
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