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Grandes lagunas en la búsqueda de secuenciar genomas de todos los animales

Fecha :
6 de diciembre de 2021
Fuente :
Universidad Estatal de Washington
Resumen :
Según un nuevo análisis, los esfuerzos para secuenciar los genomas de los animales del mundo tienden a centrarse en aquellos que más se parecen a los humanos, y el trabajo se realiza casi en su totalidad en el Norte global. Los investigadores advierten que los esfuerzos actuales están pasando por alto grandes franjas de diversidad y oportunidades.El análisis encontró que se han secuenciado y ensamblado los genomas de casi 3300 especies animales, un proceso que da contexto organizacional al ADN de un organismo. Si bien la tasa está aumentando, el número es pequeño en comparación con los 1,66 millones de especies animales del mundo, y los vertebrados hacenrepresentan la mayor parte de las secuencias actuales. Representan el 54% de todos los conjuntos, a pesar de representar solo el 3,9% de las especies animales. Por el contrario, los invertebrados del filo Arthropoda, que incluye insectos y arañas, comprenden solo el 34% de los conjuntos de datos actualesmientras que representa el 78,5% de todas las especies.
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Los esfuerzos para secuenciar los genomas de los animales del mundo tienden a centrarse en aquellos que más se asemejan a los humanos con el trabajo realizado casi en su totalidad en el Norte Global, según un análisis dirigido por la Universidad Estatal de Washington.

En un artículo publicado en Actas de las Academias Nacionales de Ciencias , investigadores de WSU y la Universidad Brigham Young advierten que los esfuerzos actuales están pasando por alto grandes franjas de diversidad y oportunidad.

El análisis encontró que se han secuenciado y ensamblado los genomas de casi 3300 especies de animales, un proceso que da contexto organizacional al ADN de un organismo. Si bien la tasa está aumentando, la cantidad es pequeña en comparación con los 1,66 millones de especies de animales del mundo.y los vertebrados constituyen la mayor parte de las secuencias actuales. Representan el 54% de todos los conjuntos, a pesar de representar solo el 3,9% de las especies animales. En cambio, los invertebrados del filo Arthropoda, que incluye insectos y arañas, comprenden solo el 34%de los conjuntos de datos actuales, mientras que representa el 78,5% de todas las especies.

"Con los ensamblajes de genoma acumulándose rápidamente, queremos pensar en dónde estamos poniendo nuestros esfuerzos. No se está distribuyendo uniformemente en el árbol de la vida animal", dijo el autor principal Scott Hotaling, un investigador postdoctoral de WSU. "Los invertebrados sontodavía muy poco representada, lo que tiene sentido dado que la gente parece preocuparse más por los vertebrados, la llamada 'megafauna carismática' ".

La familia Hominidae, que incluye grandes simios y humanos, tenía los datos del genoma más contiguos reunidos, pero el genoma humano no es el más largo: ese título es para el pez pulmonado australiano. De todos los datos genómicos, solo cinco grupos de artrópodos estaban bienrepresentados: abejas, mariposas, mosquitos, moscas de la fruta y hormigas, todos notables por la utilidad o los problemas que plantean a los humanos.

"Estamos interesados ​​en nosotros mismos, y eso no es necesariamente algo malo", dijo Paul Frandsen, autor correspondiente del artículo y profesor asistente de BYU. "Pero para comenzar a comprender ecosistemas completos, tenemos que comenzar a muestrear más dela variedad de vida para obtener una imagen más clara. Los vertebrados son componentes importantes de los ecosistemas, pero posiblemente los insectos y muchas otras criaturas pequeñas probablemente juegan un papel aún más importante porque se encuentran en la base de la red alimentaria ".

Los autores, Hotaling, Frandsen y la profesora asociada de WSU Joanna Kelley, también señalaron que la gran mayoría del trabajo de secuenciación genética se lleva a cabo en países desarrollados a menudo llamados el Norte Global porque la mayoría se encuentra en el hemisferio norte. Tres países, Estados Unidos, China y Suiza son los que más producen. Incluso hubo ciertas inclinaciones por diferentes regiones, siendo América del Norte la que más secuenciación de mamíferos e insectos, Europa de peces y Asia de aves.

En los últimos años, se han anunciado varios grandes esfuerzos de secuenciación del genoma, incluida la Earth BioGenome Initiative, que estableció un objetivo ambicioso de secuenciar toda la vida eucariota, que incluye animales, bacterias y organismos unicelulares, en los próximos 10 años.

El número actual de alrededor de 3300 conjuntos de genoma animal a junio de 2021 es un gran salto en 25 años desde que se produjo la primera secuencia del genoma animal, el gusano redondo Caenorhabditis elegans en 1998. Pero los autores calcularon que al ritmo actual de aproximadamentecuatro conjuntos de genomas por día, el objetivo de secuenciar toda la vida eucariota no se alcanzaría hasta el año 3130.

Los investigadores proponen que una forma de ayudar a impulsar más trabajo en esta área sería desarrollar infraestructura e involucrar a más investigadores de países del Sur Global, particularmente en las regiones tropicales donde también hay mucha diversidad animal.

"Si queremos construir una disciplina global, necesitamos incluir a un pueblo global", dijo Hotaling. "Es simplemente equidad básica, y desde un punto de vista científico puro, las personas que viven en áreas donde las especies están siendo secuenciadas tienen unmucho conocimiento sobre esas especies y ecosistemas. Tienen mucho que aportar ".


Fuente de la historia :

Materiales proporcionado por Universidad Estatal de Washington . Original escrito por Sara Zaske. Nota: el contenido puede editarse por estilo y longitud.


Referencia de la revista :

  1. Scott Hotaling, Joanna L. Kelley, Paul B. Frandsen. Hacia una secuencia del genoma para cada animal: ¿Dónde estamos ahora? Actas de la Academia Nacional de Ciencias , 2021; 118 52: e2109019118 DOI: 10.1073 / pnas.2109019118

cite esta página :

Washington State University. "Grandes lagunas en la búsqueda de secuenciar genomas de todos los animales". ScienceDaily. ScienceDaily, 6 de diciembre de 2021. .
Universidad Estatal de Washington. 2021, 6 de diciembre. Grandes lagunas en la búsqueda de secuenciar genomas de todos los animales. ScienceDaily . Obtenido el 6 de diciembre de 2021 de www.science-things.com/releases/2021/12/211206090620.htm
Washington State University. "Grandes lagunas en la búsqueda de secuenciar genomas de todos los animales". ScienceDaily. Www.science-things.com/releases/2021/12/211206090620.htm consultado el 6 de diciembre de 2021.

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