Un estudio realizado en Barcelona ha revelado un nuevo método para el etiquetado de proteínas que preserva las funciones y la estructura nativas de las proteínas. El estudio, publicado en Métodos de la naturaleza, propone el uso de dos epítopos de proteínas vegetales, denominados inntags, como las herramientas de etiquetado más inocuas y estables en el estudio de las interacciones físicas y funcionales de las proteínas.
Las proteínas y péptidos de varios tamaños y formas se han utilizado desde principios de los años 80 para etiquetar proteínas con muchos propósitos diferentes, que van desde la purificación por afinidad hasta la detección microscópica basada en fluorescencia en organismos completos. Sin embargo, las estrategias de marcado utilizadas hoy en día corren el riesgo de queLa función nativa de la proteína puede ser abolida o comprometida por interacciones con la etiqueta.
Un estudio dirigido por el Instituto de Biología Molecular de Barcelona y el Programa Conjunto de Biología Computacional del Instituto de Investigación en Biomedicina IRB Barcelona y el Centro de Supercomputación de Barcelona y la Universidad de Barcelona, ha analizado la lista disponible de polipéptidos conEstructura 3D para identificar entre ellos los más adecuados para fines de marcado.Las investigaciones han seleccionado los dominios de proteínas más pequeños que aún muestran determinantes estructurales fuertes para actuar como antígenos, no generan problemas de solubilidad, no comprometen la aptitud celular y no causan efectos funcionales y de localización detectables.cuando se fusiona con otras proteínas diana.
Una gran serie de herramientas de bioinformática se utilizó por primera vez para explorar todo el proteoma del planeta para seleccionar aquellas proteínas que podrían, en principio, tener buenas propiedades de marcado. Después de la curación manual de los resultados in silico, se probaron 12 candidatos de etiqueta in vivo, encontrandopropiedades excelentes o sobresalientes para todos ellos. Los inntags mantienen su integridad, estabilidad, solubilidad en extractos celulares, movilidad difusional y no causan perturbaciones funcionales importantes que causan las etiquetas comúnmente utilizadas, como MYC, FLAG o HA.han demostrado la aplicabilidad de Allergen Phl p2 y Heiven Isoform 2 en el análisis de inmunofluorescencia e inmunoprecipitación de una serie de proteínas en fibroblastos de ratón y neuronas del hipocampo.
Como son claramente más inocuos en comparación con las etiquetas de uso común, los inntags pueden ser las herramientas elegidas para realizar estudios de interactoma en todo el proteoma, análisis in situ de proteínas a nivel de molécula única o cuando la proteína objetivo no ofrece una evidencia obviaensayo funcional. La tecnología desarrollada abrirá nuevas posibilidades para los investigadores en biología celular, ya que les proporcionará un método más ordenado e imparcial para rastrear proteínas dentro de la célula.
Fuente de la historia :
Materiales proporcionado por Instituto de Investigación en Biomedicina-IRB . Nota: El contenido puede ser editado por estilo y longitud.
Referencia del diario :
Cite esta página :