Hoy se ha lanzado una nueva herramienta para ayudar a conservar uno de los mamíferos más amenazados del Reino Unido, con la publicación del primer genoma de referencia de alta calidad para el ratón de agua europeo. El genoma fue generado por científicos del Instituto Wellcome Sanger, encolaboración con la organización benéfica de conservación de animales Wildwood Trust, como parte del Proyecto Darwin Tree of Life.
El genoma, publicado hoy 24 de junio de 2021 hasta Bienvenida investigación abierta , está disponible abiertamente como referencia para los investigadores que buscan evaluar la genética de la población de topillos de agua, comprender mejor cómo ha evolucionado la especie y gestionar los esfuerzos de reintroducción.
El campañol de agua europeo Arvicola amphibius es un pequeño mamífero semiacuático que vive en las orillas de los hábitats de agua dulce y en los humedales. La especie es originaria de Europa, Asia occidental, Rusia y Kazajstán. Mientras que el campañol de agua es`` Preocupación menor '' en todo el mundo, las poblaciones del Reino Unido han disminuido hasta tal punto que la especie se considera en peligro de extinción a nivel nacional. La pérdida de hábitat y la depredación del visón americano, una especie exótica invasora, han reducido la población del Reino Unido de 7,3 millones en 1990 aaproximadamente 132.000 en 2018.
Los ratones de campo de agua obtuvieron protección legal total en el Reino Unido en 2008. En el Reino Unido se han llevado a cabo varios proyectos de conservación destinados a apoyar a las poblaciones de ratones de campo de agua, incluidos los esfuerzos para la restauración del hábitat y el control de la población de visones americanos. También hay iniciativaspara reintroducir el campañol de agua en una serie de hábitats urbanos y salvajes restaurados, así como para mitigar el impacto de nuevos desarrollos.
Los ratones de campo acuáticos europeos regresaron a Gran Bretaña de refugios sin hielo en Iberia y Europa del Este después de la última edad de hielo, y estos dos clados contribuyeron a la diversidad genética en las poblaciones del Reino Unido. Esta diversidad puede ser evidente en ciertos rasgos, como el pelaje negrode ratones de campo de agua escoceses, que es diferente de los de Inglaterra que tienden a tener pelaje marrón. Pero la riqueza total de la diversidad genética no puede estimarse solo por la apariencia. También se desconoce cuánta diversidad se ha perdido como resultado de la población recientechoque.
Hazel Ryan, oficial senior de conservación de Wildwood Trust, dijo: "Los ratones de campo de agua son animales asombrosos y no entendemos completamente lo que los ecosistemas pierden sin ellos. Son administradores de hábitat laboriosos, casi como castores en miniatura en la forma en que caen los tallos, hacen madrigueras y alteran el paisaje. Sospechamos que algunas poblaciones de topillos de agua se han vuelto endogámicas en las últimas décadas debido a la disminución del número y la fragmentación de las poblaciones debido a la pérdida de hábitat. El genoma de referencia nos ofrece una manera de comprender mejor la diversidad genética para las reintroducciones y considerarmezclar individuos para garantizar que las poblaciones tengan la mejor oportunidad de prosperar ".
Para secuenciar el genoma de referencia del ratón de agua europeo, se tomó una muestra de sangre de un individuo macho vivo de A. amphibius que formaba parte de la población reproductora en cautividad de Wildwood Trust en Kent, Reino Unido. El ADN se extrajo de esta muestra y se secuenció porcientíficos del Wellcome Sanger Institute on Pacific Biosciences instrumentos SEQUEL I e Illumina HiSeq X.
El profesor Rob Ogden, Director de Ciencias de la Conservación de la Universidad de Edimburgo, dijo: "Comprender la diversidad genética y la estructura de las poblaciones de campañoles de agua es un aspecto importante de su conservación en el Reino Unido, y es fundamental para las directrices internacionales sobre el movimiento devida silvestre para la gestión de la conservación. La liberación del genoma del ratón de agua proporciona un conjunto completo de herramientas genéticas para respaldar la sostenibilidad futura de la especie en el Reino Unido ".
El genoma del ratón de agua se publica como parte del Proyecto Darwin Tree of Life, que verá a las organizaciones asociadas secuenciar y ensamblar los genomas de 70.000 especies de animales, plantas, hongos y protistas en Gran Bretaña e Irlanda.
El profesor Mark Blaxter, líder del programa del proyecto Darwin Tree of Life en el Wellcome Sanger Institute, dijo: "El campañol acuático europeo es un excelente ejemplo de una especie británica cuya diversidad genética estamos en peligro de perder antes de quetuvo la oportunidad de registrarlo por completo. Este genoma de referencia de Arvicola amphibius de alta calidad nos permitirá hacer eso, así como apoyar los esfuerzos de conservación en curso para preservar las poblaciones existentes y reintroducir nuevas de una manera que garantice que estas poblaciones sean genéticamente robustas ".
Fuente de la historia :
Materiales proporcionado por Instituto Wellcome Trust Sanger . Nota: el contenido se puede editar por estilo y longitud.
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