La secuenciación de rutina ha brindado información sin precedentes sobre la genética de las enfermedades raras, pero la genómica no logra diagnosticar hasta la mitad de los pacientes que se someten a pruebas. Ese es el problema que los científicos alemanes abordaron en un estudio reciente en la revista Proteómica molecular y celular . Utilizando muestras de pacientes de cuatro países y una base de datos novedosa sobre el proteoma de neutrófilos, pudieron hacer diagnósticos genéticos para dos niños con neutropenia congénita grave a quienes la secuenciación típica había fallado.
"Hay muy pocos ejemplos de personas que usan múltiples '-ómicas' para investigar enfermedades raras ... pero creo que este es el futuro de la medicina personalizada", dijo el autor principal Christoph Klein, médico y director deel Hospital de Niños de la Universidad de Munich.
La enfermedad de los pacientes afecta a sus neutrófilos, glóbulos blancos repletos de proteínas tóxicas que se utilizan contra las bacterias. Cuando se interrumpe el desarrollo de los neutrófilos, lo que Klein estima que le ocurre a 1 de cada 200.000 recién nacidos, cada infección bacteriana o fúngica puede convertirse en una infección médica potencialmente mortal.emergencia.
Los neutrófilos son frágiles, lo que dificulta su estudio. El investigador postdoctoral Sebastian Hesse desarrolló un protocolo para recolectar proteínas de neutrófilos sanos. Luego, los científicos dirigidos por Piotr Grabowski en el laboratorio de proteómica de Juri Rappsilber en la Universidad Técnica de Berlín utilizaron esas células sanas para establecerun proteoma de neutrófilos de línea de base.
Luego, Hesse recolectó neutrófilos de 16 pacientes con neutropenia congénita. Algunos de ellos vivían en Alemania; para llegar a otros, tuvo que viajar hasta Turquía e Irán. Los espectrometristas de masas repitieron el mismo ensayo proteómico para comparar los neutrófilos de los pacientes con los voluntarios'.
El equipo usó perfiles de proteínas anormales para diagnosticar a dos pacientes con resultados de secuenciación del exoma no concluyentes. En el caso de un niño, un pseudogén dificultó la identificación de mutaciones en el gen que codifica la proteína; en el segundo, la cobertura incompleta de la secuenciación del exoma había omitido unmutación de punto clave. Los datos sobre la abundancia de proteínas en cada paciente llevaron a los investigadores a realizar análisis genéticos secundarios que resultaron concluyentes.
Ambas mutaciones son causas conocidas de neutropenia. "Esto pone de relieve que incluso si tiene canales altamente controlados para estudios genéticos, siempre existe el riesgo de que no esté 100 por ciento correcto", dijo Klein. En un artículo de próxima publicación,El equipo informará sobre nuevas causas genéticas de neutropenia encontradas mediante la técnica proteogenómica.
El cribado proteómico y genómico combinado aún no es práctico para todos los pacientes. "Pero, si nos fijamos en las máquinas que se están desarrollando actualmente, creo que habrá un gran potencial para el análisis de proteomas a un costo muy bajo en el futuro".Dijo Klein.
Esta investigación fue apoyada por la Fundación de Investigación Alemana, la Red Alemana sobre Enfermedades de Inmunodeficiencia Primaria, la Fundación Care-for-Rare y el Wellcome Trust.
Otros autores incluyen a Sebastian Hollizeck, Meino Rohlfs, Uta Behrends, Roya Sherkat, Hannah Tamary, Ekrem Ünal, Raz Somech, Türkan Pat? Ro? Lu, Stefan Canzar y Jutte van der Werff Ten Bosch.
Fuente de la historia :
Materiales proporcionados por Sociedad Americana de Bioquímica y Biología Molecular . Nota: el contenido se puede editar por estilo y longitud.
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