Todas las células en nuestro cuerpo llevan el diccionario de información genética, el genoma humano. Sin embargo, su forma y función están determinadas por qué genes se leen de este diccionario y se traducen en proteínas, los bloques de construcción de una célula. La "lectura"de genes activos comienza con su transcripción en los llamados ARN mensajeros ARNm, un proceso que se controla a través de una compleja red de reguladores transcripcionales. Las mutaciones en estos reguladores pueden alterar la función e identidad de las células y, por lo tanto, provocar cáncer y otros humanosenfermedades. Al mismo tiempo, el bloqueo de la transcripción anormal puede matar las células cancerosas, lo que hace que algunos reguladores transcripcionales sean objetivos atractivos para el desarrollo de fármacos.
Para comprender la función de los reguladores transcripcionales, es fundamental saber qué genes controlan directamente. Sin embargo, definir estos genes ha seguido siendo difícil, porque los métodos comúnmente utilizados, como la secuenciación de ARNm, no pueden distinguir los objetivos directos de un regulador de los efectos indirectos.de solo medir todos los ARNm en una célula, un nuevo método de creación de perfiles llamado "SLAMseq" permite a los investigadores detectar los ARNm que se crean recientemente durante un período de tiempo definido.
El inventor de este método, Stefan Ameres y su equipo Instituto de Biotecnología Molecular - IMBA ahora se asociaron con el laboratorio de Johannes Zuber Instituto de Investigación de Patología Molecular - IMP para desarrollar aún más SLAMseq para investigar objetivos directos del cáncergenes y drogas dirigidas.
Como ahora se informa en el diario ciencia , el equipo utilizó este enfoque para iluminar la función de dos reguladores transcripcionales importantes, BRD4 y MYC, que se persiguen como posibles objetivos farmacológicos en el cáncer. Para descifrar sus objetivos transcripcionales directos, los científicos combinaron SLAMseq con nuevas herramientas para la degradación selectiva de proteínas, lo que les permitió eliminar BRD4 y MYC en 30 minutos y medir los cambios resultantes en la producción de ARNm durante la próxima hora. Estos experimentos podrían aclarar las funciones principales de BRD4 y MYC en la transcripción, que había sido objeto de un largo y controvertido debate en elComunidad cientifica.
La simplicidad de SLAMseq también permitió al equipo investigar los efectos directos de la terapéutica contra el cáncer a un nivel de profundidad sin precedentes. Los inhibidores de BRD4, que actualmente se prueban en varios ensayos clínicos, provocaron efectos transcripcionales muy específicos o muy extendidos, dependiendo de la dosis a la que se apliquen. Junto con los colaboradores de la compañía farmacéutica Boehringer Ingelheim, los científicos también comenzaron a usar SLAMseq para explorar terapias combinadas, que es una de las muchas aplicaciones futuras del método.
"Estamos muy entusiasmados con las oportunidades que nuestro método abre para el futuro de la investigación del cáncer", dice Matthias Muhar, un estudiante de doctorado en el laboratorio Zuber que encabezó el estudio. "SLAMseq equipa cualquier laboratorio de investigación biológica y clínica con un laboratorio muy simpleherramienta para identificar objetivos transcripcionales directos de cualquier gen, vía o medicamento. "Él cree que los investigadores del cáncer de todo el mundo adoptarán el método rápidamente para el desarrollo y la prueba de nuevas terapias contra el cáncer".
Además, el éxito de este estudio demuestra la excelencia científica y el espíritu de colaboración que prospera en el Biocentro de Viena. El estudio se basó en una colaboración entre grupos de investigación en los tres institutos de investigación IMP, IMBA y MFPL; una asociación con Lexogen, una biotecnologíaLa compañía en el Biocentro de Viena ya ha llevado al desarrollo de un kit SLAMseq para distribuir el método a la comunidad científica.
Fuente de la historia :
Materiales proporcionado por Instituto de Investigación de Patología Molecular . Nota: El contenido puede ser editado por estilo y longitud.
Referencia del diario :
Cita esta página :