El Consorcio Internacional de Secuenciación del Genoma del Trigo IWGSC ha anunciado la producción de un conjunto de genoma completo de trigo harinero, el cereal más cultivado en el mundo, acelerando significativamente la investigación mundial sobre la mejora de cultivos. El proyecto consistió en producir un conjunto de genoma completode la variedad de trigo harinero Chinese Spring basada en lecturas de secuencia corta de Illumina ensambladas con el software DeNovoMAGICTM de NRGene.
El proyecto de colaboración público-privado es coordinado por el IWGSC y codirigido por Nils Stein de IPK Gatersleben en Alemania, Curtis Pozniak del Centro de Desarrollo de Cultivos de la Universidad de Saskatchewan en Canadá, Andrew Sharpe del Instituto Global para la Seguridad Alimentaria en Canadáy Jesse Poland de la Universidad Estatal de Kansas en los Estados Unidos. Los participantes del proyecto también incluyen investigadores de Illumina, Inc .; NRGene en Israel y los Estados Unidos; Universidad de Tel Aviv en Israel; y el Instituto Nacional Francés de Investigación Agrícola INRA.
La financiación para este proyecto fue proporcionada por Genome Canada, Genome Prairie, el Ministerio de Agricultura de Saskatchewan, las Comisiones de Desarrollo de Trigo de Saskatchewan y Alberta, y la Fundación de Investigación de Granos Occidentales a través del proyecto Canadian Triticum Applied Genomics CTAG2, la Universidad Estatal de Kansas a través delPrograma de Investigación del Genoma Vegetal de la Fundación Nacional de Ciencias de EE. UU., E Illumina, Inc.
Los nuevos datos ayudarán a acelerar la entrega de una secuencia de referencia de alta calidad del genoma del trigo harinero. Nils Stein explicó: "El nuevo conjunto de escopeta de trigo pan de novo hecho por NRGene representa un gran avance para la estrategia integrada IWGSC hacia la entregauna secuencia de referencia de alta calidad para cada uno de los 21 cromosomas de trigo harinero ".
Kellye Eversole, Directora Ejecutiva de IWGSC, dio la bienvenida a los resultados, "Los resultados preliminares obtenidos por NRGene son impresionantes. Hemos estado esperando durante varios años para tener un ensamblaje de secuencia del genoma completo de alta calidad que complemente nuestra estrategia basada en cromosomas y acelerela entrega de la secuencia. Por lo tanto, este ensamblaje viene exactamente en el momento adecuado porque puede integrarse con los recursos específicos de cromosomas IWGSC desarrollados en los últimos 10 años por ejemplo, secuencias de escopeta de cromosomas, mapas físicos y secuenciación basada en mapas físicospara entregar una secuencia de referencia de alta calidad para el genoma del trigo en menos de dos años ".
Todos los datos del ensamblaje del genoma se integrarán con datos de secuencia basados en mapas físicos para producir una secuencia ordenada de alta calidad para cada cromosoma de trigo que localice con precisión genes, elementos reguladores y marcadores a lo largo de los cromosomas, proporcionando herramientas invaluables para los mejoradores de trigo.
"Esta nueva secuencia del genoma del trigo generada por el IWGSC y sus socios es una contribución importante para comprender el modelo genético de uno de los cultivos más importantes del mundo", dijo Curtis Pozniak. "Proporcionará a los investigadores de trigo un nuevo y emocionante recurso paraidentificar los genes más influyentes importantes para la adaptación del trigo, la respuesta al estrés, la resistencia a las plagas y el rendimiento mejorado "
Los resultados de todo el ensamblaje del genoma se presentarán en varios talleres en la Conferencia de Genoma de Plantas y Animales que tendrá lugar en San Diego, Estados Unidos, del 9 al 13 de enero de 2016. Todos los datos estarán disponibles en el repositorio de secuencias de trigo IWGSC en URGI-INRA.
El trigo es el alimento básico para más del 35% de la población humana mundial y representa el 20% de todas las calorías consumidas en todo el mundo. A medida que la población mundial crece, también lo hace su dependencia del trigo. Para satisfacer las futuras demandas de un proyectoPara una población mundial de 9.600 millones en 2050, la productividad del trigo debe aumentar en un 1,6% cada año. Dado que la disponibilidad de nuevas tierras es limitada para preservar la biodiversidad y los recursos hídricos y nutrientes son cada vez más escasos, la mayor parte de este aumento debe lograrse a través de cultivos ymejora del rasgo en la tierra actualmente cultivada. Una secuencia de genoma de referencia de alta calidad proporcionará la información genómica detallada necesaria para apuntalar la investigación del trigo que garantice el logro de este objetivo.
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Materiales proporcionado por Consorcio Internacional de Secuenciación del Genoma del Trigo . Nota: El contenido puede ser editado por estilo y longitud.
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