Los genetistas han reunido los conjuntos más grandes de datos genómicos africanos disponibles hasta la fecha, creando un recurso que ayudará a los investigadores a comprender la estructura genética de África, así como los efectos de la variación genética en la función de las proteínas y las enfermedades. Los hallazgos subrayan la importancia de incluircohortes de participantes globalmente diversas en investigación genética, y se presentaron en una sesión plenaria en la Reunión Anual 2018 de la Sociedad Americana de Genética Humana ASHG en San Diego, California
Los investigadores recopilaron y analizaron datos de todo el genoma de 6.400 personas de la Uganda rural, incluidas las secuencias del genoma completo de 1.978 personas dentro de ese grupo. Combinaron esto con datos de 7.784 personas adicionales de otros países africanos, en el primer genomaestudio de asociación amplia GWAS para analizar múltiples rasgos en África.
"Este estudio representa uno de los esfuerzos más grandes y completos para identificar asociaciones genéticas con enfermedades dentro de las poblaciones africanas y proporcionará una hoja de ruta para GWAS a gran escala en toda la región", dijo Ayesha Motala, MD, FRCP, líder deel estudio y profesor de la Universidad de KwaZulu-Natal.
"Antes de nuestro trabajo, sólo había unos pocos cientos de secuencias genómicas completas disponibles en África", dijo Deepti Gurdasani, MD, PhD, del Wellcome Sanger Institute, quien presentó la investigación. "La mayor parte de la información que teníamos era dePoblaciones afroamericanas, que no capturaron la diversidad completa del continente ".
Después de recopilar los datos, la Dra. Gurdasani y sus colegas evaluaron las similitudes y diferencias genéticas dentro de la cohorte, identificando similitudes entre los que emigraron a Uganda desde las mismas regiones. También encontraron una mezcla compleja de similitudes entre los genomas de Uganda, el antiguo OrientePoblaciones africanas y genomas euroasiáticos. Estos hallazgos sugieren que los genomas modernos de Uganda representan la compleja historia de la migración en la región, y que han sido moldeados por múltiples eventos de mezcla durante miles de años, incluida la mezcla con genomas similares a los de la Europa moderna.
Además, los investigadores examinaron las influencias genéticas en una variedad de rasgos y enfermedades en la cohorte más grande de GWAS, identificando 10 nuevas asociaciones específicas para poblaciones africanas. Por ejemplo, descubrieron una asociación entre una deleción en el gen HBA1 / HBA2, conocidocausar el trastorno sanguíneo alfa talasemia y los niveles de bilirrubina en sangre. Esta deleción es común entre los africanos, se encuentra en aproximadamente el 22% de los individuos, pero es poco común entre los europeos previamente estudiados.
"Aunque se correlaciona con la enfermedad, se ha demostrado que esta variante protege a las personas de la malaria grave, que presenta una ventaja más fuerte en África que en Europa y ha permitido que la frecuencia de la variante aumente en África", explicó el Dr. Gurdasani.
El estudio también encontró una asociación entre la deleción de HBA1 / HBA2 y el nivel en sangre de la proteína HbA1c, cuyos niveles altos se utilizan a menudo para diagnosticar diabetes ". La alta frecuencia de talasemia en algunas poblaciones africanas puede afectar la precisión de esta prueba, ya que puede modificar la HbA1c independientemente de los niveles de glucosa ", dijo el Dr. Gurdasani.
Más allá de su propio análisis, los investigadores esperan que sus datos ayuden a otros científicos a comprender mejor la diversidad genética de las poblaciones africanas y a desarrollar herramientas rentables para capturar la variación del genoma para estudios futuros. El trabajo futuro también incluirá un mapeo detallado de la causa y-efectó las relaciones entre variantes genéticas mediante el examen del impacto funcional de las variantes en la expresión génica.
Como próximos pasos, los investigadores planean expandir su conjunto de datos genómicos a poblaciones de toda África, muestreando diversas poblaciones indígenas y expandiendo el GWAS a aproximadamente 75,000 individuos.
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Materiales proporcionado por Sociedad Americana de Genética Humana . Nota: el contenido se puede editar por estilo y longitud.
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