Investigadores del Wellcome Trust Sanger Institute y el Imperial College London han desarrollado Microreact, una plataforma gratuita de visualización y seguimiento de epidemias en tiempo real que se ha utilizado para monitorear brotes de ébola, zika y microbios resistentes a los antibióticos. El equipo ha colaborado conla Sociedad de Microbiología para permitir que cualquier investigador de todo el mundo comparta su información más reciente sobre brotes de enfermedades. Los detalles de la plataforma se publican en la revista Genómica microbiana .
Hasta ahora, los datos de enfermedades y la información geográfica sobre el movimiento de una infección o enfermedad a medida que evoluciona y se propaga se ha guardado en bases de datos que a menudo están fuera del alcance de las personas. Se ha dejado que los investigadores confíen en la información publicada en los artículos de investigación,que pueden estar desactualizados por muchos meses, que contienen imágenes estáticas que muestran solo una pequeña parte de toda la enfermedad o amenaza de infección.
Microreact es un sistema basado en la nube que combina el poder de los datos abiertos y la web, para proporcionar visualización y uso compartido de datos globales en tiempo real, lo que permite a cualquiera explorar y examinar información sobre brotes con una velocidad y detalle sin precedentes. Esto es cada vez más importante.en la carrera por monitorear y controlar los brotes de rápido desarrollo como el Ébola o el Zika, o la creciente amenaza de la resistencia a los antimicrobianos.
Microreact permite que los conjuntos de datos y metadatos se carguen a través de un navegador web, que luego se pueden visualizar, compartir y publicar en un artículo de investigación a través de un enlace web permanente. La asociación con Microbial Genomics permite que la revista ponga a disposición datos de posibles publicacionesa través de Microreact. Esto promueve la disponibilidad y el acceso abiertos y, al mismo tiempo, comienza a crear un recurso único para los profesionales de la salud y los científicos a nivel mundial.
El Dr. David Aanensen, Director del Centro de Vigilancia de Patógenos Genómicos una iniciativa conjunta entre el Imperial College London y el Instituto Sanger y uno de los creadores de Microreact, dijo: "Hasta ahora, la comunidad de investigación global ha estado paralizada porque los resultados son generalmentesolo se comparte en imágenes estáticas o tablas en publicaciones. Microreact permite a todos explorar la información de forma dinámica, tanto en el tiempo como en el espacio, permitiéndoles ver la imagen completa. El uso de Microreact elimina el seguimiento de enfermedades de las manos de unos pocos privilegiados y se lo da atodos los que quieran comprender la evolución de la enfermedad ".
Un ejemplo de cómo Microreact puede democratizar los datos genómicos y los conocimientos resultantes es el trabajo de la Dra. Kathryn Holt y el profesor Gordon Dougan. Recientemente han publicado dos artículos sobre la distribución global de la bacteria tifoidea en todo el mundo, que muestran la propagación epidémica de uncepa resistente. Pero también publicaron sus datos en Microreact para ayudar a otros a desarrollar su trabajo.
La Dra. Kathryn Holt, de la Universidad de Melbourne, dijo: "Recopilamos datos de casi 2000 muestras de bacterias Salmonella Typhi recolectadas por 74 colaboradores en 63 países. Comparando las diferentes cepas y mapeando cuándo y dónde fueron 'capturadas"pudimos demostrar que una nueva cepa resistente a los medicamentos surgió en Asia y se ha extendido por ese continente y África. Hemos puesto toda esta información en Microreact y ahora cualquiera puede ver exactamente lo que vimos, tanto los científicos como el públicoprofesionales de la salud encargados de controlar esos brotes ".
Al poner esta información en Microreact, los investigadores se han asegurado de que los datos continúen viviendo, lo que permite que otros aprendan de su trabajo y utilicen la información como base de comparación o fundamento para trabajos futuros. Microreact también permite a los investigadores individualespara compartir información a nivel mundial y en tiempo real, mediante el crowdsourcing de nuevos descubrimientos y conocimientos que podrían tener un impacto inmediato.
Leighton Chipperfield, Director de Publicaciones de la Sociedad de Microbiología dijo: "Estamos encantados de que nuestra revista de acceso abierto y datos abiertos Microbial Genomics se asocie con Microreact. Todos los proyectos de Microreact que aparecen en los artículos de Microbial Genomics se destacarán en lasitio web para aumentar la capacidad de descubrimiento y accesibilidad de los conjuntos de datos de los investigadores ".
Fuente de la historia :
Materiales proporcionado por Instituto Wellcome Trust Sanger . Nota: el contenido se puede editar por estilo y longitud.
Referencia de la revista :
cite esta página :