Los científicos de Bristol han demostrado una nueva técnica de realidad virtual [VR] que debería ayudar a desarrollar fármacos contra el virus SARS-CoV-2 y permitir a los investigadores compartir modelos y colaborar de nuevas formas. La herramienta innovadora, creada por la Universidad deInvestigadores de Bristol, y publicado en el Revista de información química y modelado , ayudará a los científicos de todo el mundo a identificar las pistas de fármacos antivirales más rápidamente.
Una enzima del SARS-CoV-2 conocida como la proteasa principal Mpro es un objetivo prometedor en la búsqueda de nuevos tratamientos antivirales. Las moléculas que impiden que funcione la proteasa principal, llamadas inhibidores de la enzima, detienen la reproducción del virus.y, por lo tanto, podrían ser medicamentos eficaces. Investigadores de todo el mundo están trabajando para encontrar este tipo de moléculas. Un factor clave para predecir la eficacia de un medicamento es la firmeza con que se une a su objetivo; saber cómo encaja un medicamento en la proteína ayuda a los investigadores a diseñar cambios en su estructurapara que se adhiera más fuerte.
El profesor Adrian Mulholland de la Facultad de Química de Bristol y autor principal del estudio explicó: "Hemos demostrado que la realidad virtual interactiva puede modelar cómo las proteínas virales y los inhibidores se unen a la enzima. Los investigadores pueden usar esta herramienta para ayudar a comprender cómo funciona la enzima, y también para ver cómo los medicamentos potenciales encajan en la enzima. Esto debería ayudar a diseñar y probar nuevos potenciales de medicamentos. Estamos compartiendo estos modelos con toda la comunidad ".
El equipo de Bristol ha desarrollado un marco virtual para simulaciones interactivas de 'dinámica molecular'. Es un marco de software de código abierto, llamado Narupa, que utiliza equipos de realidad virtual fácilmente disponibles.
En este estudio, el equipo de Bristol creó una estructura de modelo 3D del SARS-CoV-2 Mpro y utilizó simulaciones interactivas de dinámica molecular en VR iMD-VR para 'entrar' y visualizar moléculas que se unen a la enzima, endetalle atómico. Los resultados mostraron que los usuarios podían mostrar cómo encaja una molécula de fármaco dentro de la enzima.
El profesor Mulholland agregó: "En la actualidad, hay muchos esfuerzos a nivel mundial dirigidos a identificar pistas de medicamentos para COVID-19. Nuestras herramientas iMD-VR serán un recurso valioso, que permitirá la colaboración virtual para la comunidad internacional de descubrimiento de medicamentos, ayudando a predecir cómo los medicamentos potencialeslos clientes potenciales se unen a los objetivos del SARS-CoV-2. Un aspecto interesante es que también permite a los investigadores colaborar de nuevas formas: utilizando la computación en la nube, pueden abordar juntos un problema de descubrimiento de fármacos al mismo tiempo cuando se encuentran en diferentes ubicaciones.potencialmente incluso en diferentes países, trabajando simultáneamente en el mismo entorno molecular virtual ".
"El modelado computacional de cómo los fármacos se unen a la proteína pico del SARS-CoV-2 ha sido fundamental para avanzar en la lucha global contra la pandemia. Narupa lleva ese modelado a un nivel completamente nuevo con simulaciones de dinámica molecular en realidad virtual", dijo Alison.Derbenwick Miller, vicepresidente de investigación de Oracle. "Estamos encantados de que la infraestructura en la nube de alto rendimiento de Oracle respaldara el desarrollo de este marco innovador y ahora esté ayudando a avanzar en los esfuerzos conectados a nivel mundial para derrotar a COVID-19. Crecimiento de una comunidad conectada deinvestigadores basados en la nube es exactamente para lo que se diseñó Oracle for Research ".
El estudio fue apoyado por subvenciones del EPSRC, la Royal Society y la Sociedad Británica de Quimioterapia Antimicrobiana. Los créditos en la nube fueron proporcionados por Oracle for Research.
Fuente de la historia :
Materiales proporcionado por Universidad de Bristol . Nota: el contenido se puede editar por estilo y longitud.
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