Las historias de los marineros sobre el Kraken, un monstruo marino gigante que acecha en el abismo, pueden tener un elemento de verdad.
En 1857, el naturalista danés Japetus Steenstrup relacionó los relatos de los barcos que fueron arrastrados al fondo del océano con la existencia del calamar gigante: un invertebrado de diez brazos, que se cree creíblemente que crece hasta 13 metros y pesa más de 900kg.
Ahora, más de 160 años después, un equipo internacional de científicos ha secuenciado y anotado el genoma de un calamar gigante.
'Estos nuevos resultados pueden desbloquear varias preguntas evolutivas pendientes con respecto a esta especie de manto', dice el líder de la investigación, el profesor asociado Rute da Fonseca del Centro de Macroecología, Evolución y Clima CMEC en el Instituto Globe de la Universidad de Copenhague.
Más datos, más preguntas
A lo largo de los años, solo quedan relativamente pocos calamares gigantes, o Architeuthis dux - se han recopilado en todo el mundo.
Usando secuencias de ADN mitocondrial de tales muestras, los investigadores de la Universidad de Copenhague han confirmado previamente que todos los calamares gigantes pertenecen a una sola especie.
'Sin embargo, nuestro análisis genético inicial generó más preguntas de las que respondió', dice el profesor Tom Gilbert del Instituto GLOBE, que formó parte del trabajo anterior sobre la criatura gigante.
Producir un ensamblaje de genoma de alta calidad para el calamar gigante resultó tan desafiante como detectar uno de estos animales en su entorno natural. Sin embargo, este fue un esfuerzo importante ya que el genoma es el conjunto de herramientas definitivo disponible para un organismo.
Muestras que no cooperan
Los desafíos en el laboratorio comenzaron con el hecho de que las muestras disponibles provienen de animales en descomposición, generalmente conservados en formalina o etanol en museos de todo el mundo.
Esto significa que la mayoría de ellos no se pueden utilizar para obtener el ADN de alta calidad necesario para un buen ensamblaje del genoma.
Además, los niveles elevados de amoníaco y polisacáridos en los tejidos probablemente fueron los causantes de los repetidos fallos en la producción de bibliotecas adecuadas para casi todas las tecnologías de secuenciación disponibles.
'Este proyecto nos recuerda que hay muchas especies que requieren procedimientos de laboratorio y bioinformáticos optimizados individualmente. Un esfuerzo que a veces se subestima cuando se diseñan enfoques de un solo proceso en grandes consorcios de secuenciación del genoma', dice Rute da Fonseca,quien comenzó a liderar el proyecto cuando trabajaba como profesor asistente en el Departamento de Biología de la Universidad de Copenhague.
Un primer paso para conocer al gigante
A pesar de los muchos desafíos, el grupo de investigación logró hacerse con una muestra de tejido recién congelado de un calamar gigante recolectado por un barco pesquero cerca de Nueva Zelanda. Un increíble golpe de suerte, según el líder de la investigación.
Con esta muestra, los investigadores pudieron producir el mejor genoma de cefalópodo disponible actualmente.
Este 'borrador genómico' brinda una posibilidad única para abordar muchas preguntas emergentes de la evolución del genoma de los cefalópodos, explican los investigadores detrás del estudio.
Al permitir la comparación del calamar gigante con los genomas de tipos de cefalópodos más conocidos, los científicos ahora esperan descubrir más sobre las misteriosas criaturas gigantes, sin necesariamente tener que atraparlas u observarlas en profundidades de hasta 1200 metros.que habitan.
Por ejemplo, los nuevos datos genómicos podrían permitir a los científicos explorar los fundamentos genéticos del tamaño, la tasa de crecimiento y la edad del calamar gigante.
Fuente de la historia :
Materiales proporcionado por Facultad de Salud y Ciencias Médicas de la Universidad de Copenhague . Nota: el contenido se puede editar por estilo y longitud.
Referencia de la revista :
cite esta página :