Un equipo internacional de investigadores ha mapeado el genoma de Nemo, proporcionando a la comunidad investigadora un recurso invaluable para decodificar la respuesta de los peces a los cambios ambientales, incluido el cambio climático.
En un estudio innovador dirigido por la Universidad de Ciencia y Tecnología King Abdullah KAUST y el Centro de Excelencia ARC para Estudios de Arrecifes de Coral Coral CoE, los investigadores utilizaron herramientas de secuenciación de alta tecnología para crear uno de los mapas genéticos más completospara el pez payaso naranja, un habitante común de los arrecifes y estrella de la película de Disney, Finding Nemo.
"Este genoma proporciona un modelo esencial para comprender cada aspecto de la biología de los peces de arrecife", dijo el autor principal, el Dr. Robert Lehmann de KAUST en Arabia Saudita.
"Contiene 26.597 genes codificadores de proteínas. Y como el rompecabezas más grande del mundo, tomó paciencia y tiempo ensamblarlo".
El pez payaso naranja Amphiprion percula , no solo es el pez de arrecife más reconocido en la Tierra, sino también uno de los más estudiados.
"Esta especie ha sido fundamental para la investigación innovadora en los aspectos ecológicos, ambientales y evolutivos de los peces de arrecife", dijo el coautor Profesor Philip Munday de Coral CoE en la Universidad James Cook en Australia.
"Por ejemplo, el pez payaso es un modelo para estudiar el cambio de sexo en los peces. También nos ha ayudado a comprender los patrones de dispersión larval en los peces de arrecife y es la primera especie de peces para la que se demostró que el comportamiento de evitación de depredadores podría verse afectado porAcidificación oceánica."
El equipo usó tecnología de punta para secuenciar el genoma del pez payaso. Sus datos genómicos y transcriptómicos ahora están disponibles a través de la base de datos Nemo Genome DB en http://nemogenome.org .
"El pez payaso comprende aproximadamente 939 millones de nucleótidos que necesitaban encajar", dijo el coautor Profesor Timothy Ravasi de KAUST.
"Este es un recurso extremadamente valioso para la comunidad de investigación y establecerá aún más al pez payaso naranja como un sujeto de laboratorio ideal para estudios genéticos y genómicos"
"Este es uno de los genomas de peces más completos jamás producidos", dijo el coautor profesor David Miller de Coral CoE en la Universidad James Cook.
"El uso de la tecnología de secuenciación en tiempo real de la molécula única PacBio nos permitió lograr un resultado pulido"
El artículo "Buscando los genes de Nemo: un ensamblaje de referencia a escala cromosómica del genoma del pez payaso organge, Amhiprion percula" se publica hoy en la revista Recursos de ecología molecular .
Fuente de la historia :
Materiales proporcionado por Centro de excelencia ARC en estudios de arrecifes de coral . Nota: El contenido puede ser editado por estilo y longitud.
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