El microbiólogo Steve Techtmann ganó un premio DARPA Young Faculty Award YFA para estudiar las biofirmas microbianas que identifican qué aguas atraviesan.
Techtmann, profesor asistente de biología e investigador del Centro de Investigación de los Grandes Lagos de la Universidad Tecnológica de Michigan, está buscando un solo microbio. O más bien 22 de ellos. En cada puerto que visita en todo el mundo, desde Singapur hasta RotterdamGreen Bay: espera encontrar una especie de microbio única en cada lugar. Si el genoma del microbio es lo suficientemente distinto, podría usarse como un marcador para ver a dónde han viajado los barcos. Finalmente, la técnica podría usarse para mejorar la defensa.así como el monitoreo ambiental.
Viajará este verano y otoño para recolectar muestras de agua de puertos y enviar sentinas desde 22 puertos de todo el mundo. Su trabajo comenzó más cerca de casa con puertos alrededor del Lago Superior, donde el equipo de Techtmann encontró al menos un género único en varias ciudades de los alrededores.El lago superior.
"El barco es como una trampa de moscas para los microbios, ya que atraviesa estos puertos", dice Techtmann, y agrega que diferentes microbios pueden preferir el agua abierta sobre las sentinas, ya que tienden a ser oscuros, varían en niveles de nutrientes y a veces son grasosos ".El otro desafío es que los barcos podrían estar trayendo microbios de otros puertos, lo que complica la firma ".
Para clasificar en qué microbios se encuentran dónde, Techtmann y su equipo de investigación recolectarán 30-50 muestras de los 22 puertos que estudiarán. En muchos estudios microbianos, se pueden usar tan solo tres o cuatro muestras para examinar los microbiosen un entorno. Pero para determinar qué microbios son especies características y cuáles también están presentes en el agua de sentina, y luego comparar todos los puertos para ver si hay superposición, se requiere una potencia informática adicional y, por lo tanto, más muestras.combine el aprendizaje automático y la secuenciación del genoma para desarrollar una herramienta sensible que analice todas las diferentes muestras de agua e identifique la composición de cada una.
Esto podría conducir a lo que Techtmann llama "sensores espaciales" en los que la identificación de microbios clave proporciona información sobre la interfaz entre la biología y la geografía. Los sensores espaciales microbianos podrían usarse potencialmente para evaluar si un humedal está completamente recuperado o para monitorear la propagación de un contaminante.
"En un nivel básico, está tratando de entender qué hace que un conjunto de organismos viva en un lugar sobre otro", dice, y agrega que hay un dicho en la ecología microbiana de que "todo está en todas partes, pero la naturaleza selecciona".
Determinar las firmas biológicas microbianas de los puertos de todo el mundo es una forma de ver si esta hipótesis se mantiene o si se apaga con el agua de sentina.
Fuente de la historia :
Materiales proporcionado por Universidad Tecnológica de Michigan . Nota: El contenido puede ser editado por estilo y longitud.
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