Las transferencias de genes son particularmente comunes en los genes de resistencia a antibióticos de Streptococcus pneumoniae bacterias
Cuando los mamíferos se reproducen, el genoma de la descendencia es una combinación de los genomas de los padres. Las bacterias, por el contrario, se reproducen a través de la división celular. En teoría, esto significa que los genomas de la descendencia son copias del genoma original. Sin embargo,el proceso no es tan sencillo como esto debido a la transferencia horizontal de genes a través de la cual las bacterias pueden transferir fragmentos de su genoma entre sí. Como resultado de este fenómeno, el genoma de una bacteria individual puede ser una combinación de genes de varios donantes diferentesAlgunos de los fragmentos del genoma pueden incluso originarse de especies completamente diferentes.
En un estudio reciente que combina el aprendizaje automático y la bioinformática, se desarrolló un nuevo método computacional para modelar las transferencias de genes entre diferentes linajes de una población bacteriana o incluso entre especies bacterianas completamente diferentes. El método se utilizó para analizar una colección de 616 genomas completosde un patógeno recombinogénico Streptococcus pneumoniae .
La utilidad de un gen afecta su velocidad de transferencia
En el estudio, se identificaron varios genes individuales en los que las transferencias de genes se consideraban particularmente comunes. Estos genes también incluían genes que causaban resistencia a los antibióticos.
'En el caso de los genes de resistencia a antibióticos, el número de transferencias de genes puede estar relacionado con la utilidad de estos genes para las bacterias y la presión de selección resultante', dice Pekka Marttinen, investigadora de la Academia del Departamento de Informática de la Universidad de Aalto.
'El estudio no proporcionará una solución directa a la resistencia a los antibióticos porque esto requeriría una comprensión profunda de cómo se produce y se propaga la resistencia. Sin embargo, saber en qué medida se produce la transferencia de genes entre diferentes especies y linajes puede ayudar a mejorar esta comprensión', el explica.
El estudio pudo demostrar que la transferencia de genes ocurre tanto dentro de las especies como entre varias especies diferentes. El gran número de transferencias identificadas durante el estudio fue una sorpresa para los investigadores.
'Estudios anteriores han demostrado que las transferencias de genes son comunes en genes individuales, pero nuestro equipo fue el primero en utilizar un método computacional para mostrar el alcance de la transferencia de genes en todo el genoma', dice Marttinen.
'El método también permite examinar efectivamente las transferencias de genes ancestrales por primera vez, lo cual es importante para examinar las transferencias entre diferentes especies'
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Materiales proporcionado por Universidad de Aalto . Nota: El contenido puede ser editado por estilo y longitud.
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