Un nuevo estudio del Translational Genomics Research Institute TGen detalla el diseño y la validación de una herramienta de detección de bajo costo, rápida y altamente precisa, conocida como KlebSeq, para infecciones potencialmente mortales adquiridas en el cuidado de la salud HAI, comocomo Klebsiella pneumoniae . Las HAI afectan a cientos de miles de pacientes anualmente y agregan casi $ 10 mil millones en costos de atención médica asociados.
Los resultados, que se publicarán en la edición de octubre de la Revista de Microbiología Clínica , detalle el funcionamiento de la prueba KlebSeq para detectar HAI antes, en particular Klebsiella que tiene múltiples cepas, como ST258, que son cada vez más resistentes al tratamiento con antibióticos.
A diferencia de los ensayos tradicionales que requieren cultivar un cultivo vivo en un entorno de laboratorio, lo que agrega días al proceso de prueba y capas en el costo, KlebSeq emplea una técnica llamada secuenciación de amplicones que identifica la presencia de Klebsiella y estratifica sus características, como el tipo de cepa y si puede ser resistente a los antibióticos.
"KlebSeq es capaz de identificar y caracterizar de manera precisa y consistente Klebsiella de muchos tipos diferentes de muestras, incluyendo sangre, orina, muestras nasales y fluidos respiratorios ", dijo la Dra. Jolene Bowers, becaria posdoctoral en la División de Genómica de Patógenos de TGen, TGen North, y la primera autora del artículo.
En 2015, Bowers codirigió un estudio publicado en PLOS UNO , en colaboración con los Centros para el Control y la Prevención de Enfermedades de EE. UU., Que documentaron la rápida propagación mundial de ST258.
Según los CDC, casi 2 millones de estadounidenses anualmente contraen infecciones bacterianas que son resistentes a al menos un antibiótico, y 23,000 mueren cada año por tales infecciones, casi el doble que mueren de SIDA.
"La tecnología de prueba mejorada tiene un gran potencial para la detección rápida de HAI e identificar más rápidamente las infecciones resistentes a los antibióticos, como por ejemplo K. Pneumoniae que se ha convertido en una crisis urgente de salud pública ", dijo Bowers." KlebSeq es un ejemplo perfecto del poder de las herramientas analíticas basadas en genómica que brindan resultados más rápidos, más precisos y a un costo menor ".
Según el Dr. David Engelthaler, Director de Programas y Operaciones de TGen North, y uno de los autores del estudio, transmisión de cepas resistentes a múltiples fármacos de K. Pneumoniae es rápido y sin síntomas iniciales, lo que lleva a brotes en el sistema de salud y la comunidad que a menudo no se detectan.
"Detección temprana de K. Pneumoniae en pacientes de atención médica, especialmente aquellos con cepas resistentes a múltiples medicamentos, es fundamental para el control de infecciones ", dijo el Dr. Engelthaler, quien también es un ex epidemiólogo para el estado de Arizona." Quizás lo más preocupante es que Kleb actúa como una lanzadera paragenes de resistencia crítica, a menudo transmitiéndolos a otras especies de HAI. Es importante para nosotros detectar tanto las bacterias como estos genes críticos ".
KlebSeq se puede usar para la detección y vigilancia de rutina, lo que permite al personal de atención médica tomar decisiones más informadas sobre los pacientes y frenar las situaciones de brote al identificar rápidamente las transmisiones de pacientes anteriores que muestran signos de infección. Clasificar el tipo de infección en cada paciente ayudaría a habilitar una instituciónpara decidir cuándo y qué procedimientos de intervención promulgar.
Los resultados del estudio sugieren que KlebSeq sería especialmente útil para pacientes de alto riesgo: aquellos en unidades de cuidados intensivos, centros especializados en trasplante de médula ósea o pacientes con inmunodepresión crónica, centros de atención a largo plazo y viajeros que regresan de regiones endémicas.
"La sensibilidad de KlebSeq es superior a los métodos basados en la cultura", dijo el Dr. Paul Keim, Director de TGen North y autor principal del estudio.
"KlebSeq es un paso importante hacia una herramienta integral, pero accesible, para toda identificación y caracterización de patógenos", dijo el Dr. Keim, quien también es el Presidente de Microbiología de Cowden en la Universidad del Norte de Arizona y Director del Centro para Microbios de NAUGenética y Genómica MGGen.
Los resultados también sugieren que KlebSeq podría modificarse fácilmente para detectar otros agentes infecciosos adquiridos en el cuidado de la salud e identificar aquellos con resistencia a los antimicrobianos. También podría usarse para la detección de brotes, mapeo de transmisión y rastreo de la fuente de infecciones al poder detectarcientos de muestras de pacientes simultáneamente, a un costo de decenas de dólares por paciente.
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Materiales proporcionado por El Instituto de Investigación de Genómica Traslacional . Nota: El contenido puede ser editado por estilo y longitud.
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