Los científicos del Instituto Karolinska en colaboración con el Centro de Competencia de Estonia en Tecnologías de la Salud han desarrollado un nuevo método de análisis de expresión génica para ampliar el uso de la sangre en el descubrimiento y análisis de biomarcadores. Su artículo se publica en la revista Informes científicos .
La sangre transporta células que proporcionan biomarcadores para una serie de aplicaciones. La sangre como un tipo de biopsia líquida se usa ampliamente en la investigación clínica debido a su facilidad de muestreo y su dinámica rápida: la mayoría de las células son eritrocitos que transportan oxígeno, lo que causa50 - 80 por ciento de enriquecimiento de las moléculas de ARN de la globina entre todos los ARN de la sangre. Esta alta prevalencia de la globina complica los estudios de biomarcadores de expresión génica relacionados con la sangre, provocando un sesgo técnico y dejando indetectables las moléculas biológicamente relevantes.
Según los investigadores, el estudio revela por primera vez la metodología detallada, GlobinLockTM, cómo superar una limitación en el análisis de muestras de sangre causada por los eritrocitos, lo que complica cualquier identificación o rastreo de biomarcadores aguas abajo.el ensayo minimiza las necesidades de reactivos y material de muestra, lo que lo convierte en una herramienta eficaz y robusta.
"La tasa de reducción de globina de GlobinLock es suficiente para cualquier aplicación. Reduce la prevalencia de globina del 63 por ciento antes al cinco por ciento, lo que lo convierte en una herramienta eficaz para las empresas de biotecnología como un aditivo para sus kits", dijo el Dr. Kaarel Krjutškov,el autor principal del estudio del Instituto Karolinska y del Centro de Competencia de Estonia en Tecnologías de la Salud.
El nuevo método consiste en un par de cadenas cortas de ADN sintético que silencian a la mayoría de las moléculas de ARN de la globina mediante una unión altamente específica. Las cadenas se introducen en una muestra de ARN purificada y, según los investigadores, son efectivas inmediatamente después de la desnaturalización del ARN y agregan solodiez minutos de tiempo de incubación para todo el procedimiento de síntesis de ADN complementario. Las moléculas de ADN de bloqueo se unen específicamente en el sitio de poli-A de ARN de globina que se necesita para un análisis posterior. Por lo tanto, los ARN de globina están "bloqueados" antes de manipulaciones posteriores y no están disponibles para causar técnicassesgos en las aplicaciones de biomarcadores de ARN en sangre.
"Mostramos que el bloqueo de la globina es totalmente efectivo no solo para muestras humanas sino también para modelos animales ampliamente utilizados, como ratones y ratas, vacas, perros e incluso peces cebra", dijo la profesora Juha Kere en el laboratorio de Karolinska que creó la invención en KarolinskaInstituto
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Materiales proporcionado por Instituto Karolinska . Nota: El contenido puede ser editado por estilo y longitud.
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