Algunos de los casos finales de Ébola en Sierra Leona se transmitieron a través de rutas no convencionales, como el semen y la leche materna, según el análisis más grande hasta la fecha del final de la epidemia.
Un equipo internacional de investigadores ha producido una imagen detallada de las últimas etapas del brote en Sierra Leona, utilizando la secuenciación en tiempo real de los genomas del virus del Ébola realizada en un laboratorio temporal en el país.
Si bien el estudio no sugirió que la transmisión no convencional fuera más común de lo que se pensaba anteriormente, los autores describen varios casos, incluida una madre que pudo haber transmitido el Ébola a su bebé a través de la lactancia materna y un sobreviviente del Ébola que transmitió el virus sexualmente un mes despuésser liberado de la cuarentena. [Más detalles de los casos en las notas a los editores].
La investigación, publicada en la revista Evolución del virus , sugiere que la secuenciación rápida de genomas virales en medio de una epidemia podría desempeñar un papel vital en el control de brotes futuros, al permitir que los trabajadores de salud pública rastreen rápidamente nuevos casos hasta su origen.
Sierra Leona fue el más afectado de los tres países de África occidental más afectados por la epidemia de Ébola, con 14,124 casos y 3,956 muertes hasta la fecha. Sin vacunas o tratamientos efectivos para la infección, controlar la epidemia dependía en gran medida de la salud públicamedidas tales como la identificación rápida y el aislamiento de pacientes con ébola, el rastreo de contactos y la cuarentena, así como el fomento de prácticas de enterramiento seguras.
A mediados de 2015, los casos en los tres países más afectados habían disminuido, pero los casos aislados de la enfermedad continuaron apareciendo, a pesar de que se creía que todas las cadenas de transmisión conocidas se habían extinguido.
Los investigadores dirigidos por la Universidad de Cambridge y el Wellcome Trust Sanger Institute comenzaron a investigar estos casos en una instalación de secuenciación genómica temporal establecida por el profesor Ian Goodfellow. Basado en una tienda de campaña en el Centro de Tratamiento del Ébola en Makeni, Sierra Leona, la instalación proporcionada en-la capacidad de secuenciación en el país para procesar muestras de pacientes en Makeni y sus alrededores en tiempo real, sin la necesidad de enviar muestras fuera del país.
El equipo generó 554 secuencias completas del genoma del Ébola a partir de muestras de sangre, hisopos bucales, semen y leche materna recolectados entre diciembre de 2014 y septiembre de 2015 de los centros de aislamiento y tratamiento del Ébola en el norte y oeste del país. Estos se combinaron con 1019 muestrassecuenciado por otros grupos para crear una imagen de las variantes virales presentes en Sierra Leona.
Descubrieron que durante 2015 circulaban al menos nueve linajes diferentes del virus en Sierra Leona, ocho de los cuales evolucionaron a partir de una única variante que introdujo el Ébola en el país en junio de 2014. Los virus restantes provenían de un linaje geográficamente distinto.que se originó en Guinea.
A partir de mediados de 2015, las muestras de todos los casos nuevos de Sierra Leona se secuenciaron rápidamente en la instalación. Los datos, combinados con el creciente conjunto de referencia, ayudaron a los trabajadores de campo a localizar la fuente de infección para algunos de los casos finales de Ébola en Sierra Leona.Este trabajo reveló que algunos casos se adquirieron a través de cadenas de transmisión no convencionales y respalda una creciente evidencia de que el virus Ébola se puede encontrar en fluidos como el semen o la leche materna y puede persistir más allá de los tiempos de cuarentena estándar.
El autor principal, el profesor Ian Goodfellow, de la Universidad de Cambridge, dijo: "Durante la parte inicial de la epidemia de Ébola, varios equipos secuenciaron muestras, pero los retrasos causados por el envío de las muestras fuera de África occidental dificultaron el uso de la secuenciadatos para investigar nuevas cadenas de transmisión. A menudo, para cuando se publicaron los datos, las muestras tenían seis meses de antigüedad. Para poder identificar rápidamente la fuente de nuevos casos, necesitamos secuenciar las muestras y liberar datos en tiempo real, compartir muestras ycompartir datos a medida que se producen "
El Dr. Matthew Cotten, autor principal conjunto del Instituto Wellcome Trust Sanger agregó: "Durante la epidemia, la combinación de nuestras secuencias del genoma del virus del Ébola con datos de otros grupos proporcionó información sobre cómo estaba evolucionando el virus y contribuyó a una referencia importante para rastrear elfuente de nuevos casos. A medida que avanzó el brote, nuestros datos también muestran que las cuarentenas, el control fronterizo y los métodos de control fueron efectivos, ya que cesó el movimiento del virus dentro y entre países ".
La instalación de secuenciación establecida por el equipo ahora se ha trasladado a la Universidad de Makeni, donde forma el punto focal del nuevo Laboratorio de Investigación de Enfermedades Infecciosas UniMak. La instalación está proporcionando capacitación de clase mundial a estudiantes y científicos locales, queha demostrado ser crucial para secuenciar los nuevos casos recientes de Ébola cuando no había personal internacional presente.
El Dr. Jeremy Farrar, Director de Wellcome Trust, dijo: "El contacto cercano con una persona infectada sigue siendo, con mucho, la forma más común de propagación del Ébola, pero este estudio respalda investigaciones anteriores que sugieren que el virus puede persistir en los fluidos corporales durantemucho tiempo después de la recuperación. Estos modos inusuales de transmisión pueden haber contribuido a brotes aislados de infecciones hacia el final de la epidemia.
"El éxito de este innovador proyecto muestra cuán importante es llevar a cabo la secuenciación del genoma dentro de los países afectados y que los datos se compartan de manera rápida y abierta como parte de la respuesta epidémica. Fortalecimiento de las instalaciones de laboratorio y vigilancia dondeactualmente no existen y también ayudarán a la detección temprana, haciendo que el mundo esté mejor preparado para los brotes de enfermedades infecciosas ".
Fuente de la historia :
Materiales proporcionado por Wellcome Trust . Nota: El contenido puede ser editado por estilo y longitud.
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