Los investigadores a menudo analizan biomoléculas aisladas en tubos de ensayo, y es dudoso que los resultados puedan aplicarse a células densamente empaquetadas. Un equipo de Bochum, Dortmund y Greifswald monitoreó el plegamiento de una estructura de ARN en la célula viva y comparó los resultadoscon los de análisis de probeta.
El equipo estudió el comportamiento de una estructura de ARN del microorganismo Salmonella en tres escenarios diferentes: en una célula viva; en una solución acuosa sin aditivos; y en una solución acuosa con varios aditivos que se suponía que imitaban las moléculas en las células.
Los aditivos artificiales afectan el comportamiento del ARN
Los aditivos en el tubo de ensayo afectaron el comportamiento de las moléculas de ARN, según la composición química del aditivo y su concentración y tamaño. Teniendo en cuenta esos resultados, los investigadores esperaban la molécula de ARN en la célula viva, que esDensamente empaquetado con varias moléculas, para exhibir un comportamiento diferente al de la molécula de ARN en la solución acuosa sin aditivos
"Para nuestra sorpresa, no encontramos diferencias, en promedio, entre la célula viva y la solución acuosa diluida", dice el profesor junior Dr. Simon Ebbinghaus del Departamento de Química Física II de la Ruhr-Universität Bochum, quiendelinea los resultados en las revistas " Angewandte Chemie "y" Edición internacional Angewandte Chemie , "junto con colegas de RUB en el Departamento de Biología, en TU Dortmund y en la Universidad Ernst Moritz Arndt de Greifswald.
Celda y solución acuosa diluida no diferente
"Debido a que contiene una gran cantidad de macromoléculas, el entorno celular es altamente concentrado y viscoso, similar al que simulamos usando aditivos artificiales", explica Ebbinghaus. "Sin embargo, a diferencia de los aditivos artificiales, el entorno celular parece modificar elEstabilidad del ARN solo marginalmente "
En el curso del estudio, los investigadores analizaron un termómetro de ARN con una estructura de horquilla. A una temperatura más alta, la estructura se fusiona, provocando así una respuesta de choque térmico en microorganismos. Las marcas de color en los extremos de la estructura permitieron a los investigadorespara controlar si la horquilla se desplegó en diferentes condiciones o no.
Fuertes fluctuaciones en la estabilidad del ARN en células vivas
Los investigadores sospechan que la estabilidad del termómetro de ARN varió mucho más que en el tubo de ensayo. Los cambios dinámicos en el entorno celular pueden afectar el plegamiento continuo del ARN, sospechan los investigadores. El entorno celular podría constituir un factor crucial paraLa regulación y modulación de varios procesos biológicos.
Fuente de la historia :
Materiales proporcionado por Ruhr-Universidad Bochum . Nota: El contenido puede ser editado por estilo y longitud.
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