La Tierra alberga una gran cantidad de formas de vida, desde animales y plantas bien conocidos hasta formas de vida pequeñas y más resistentes, como arqueas, virus y bacterias. Estas formas de vida son fundamentalmente diferentes hasta el nivel celular. Oasí lo pensaron los científicos
Ahora, un equipo internacional de investigadores ha analizado las proteínas encontradas en 100 especies diferentes, desde bacterias y arqueas hasta plantas y humanos. Es el mapeo de proteínas más grande que se haya realizado en diferentes especies.
Han aprendido que estas formas de vida tienen una serie de características comunes. El estudio es una colaboración entre investigadores del grupo del profesor Matthias Mann en el Centro de Investigación de Proteínas de la Fundación Novo Nordisk y el Instituto de Bioquímica Max Planck. Ha sidopublicado en la principal revista científica Naturaleza .
'Hemos mapeado las proteínas, juntas llamadas el proteoma de 100 especies diferentes. Y es obvio que son extremadamente diferentes. Sin embargo, al mismo tiempo, tienen más en común de lo que pensábamos. En todas estas formas de vida,una gran parte de las proteínas se centran en el metabolismo y en mantener un equilibrio de proteínas ', dice el profesor Matthias Mann.
Duplicación de proteínas confirmadas experimentalmente
Anteriormente, los investigadores estaban interesados principalmente en el ADN de varios organismos. Por ejemplo, cuánto material genético los humanos comparten con diferentes animales. Sin embargo, con los avances en la tecnología utilizada para estudiar organismos a nivel molecular, los investigadores han recurrido a las proteínas, los caballos de batallade la celda.
'Una característica común de todas estas formas de vida es el hecho de que un alto porcentaje de sus proteomas se enfoca en mantener una especie de equilibrio, lo que se llama homeostasis. Otra característica común es el hecho de que una gran parte de las proteínas ayudan agenerar energía. Aunque las formas en que se hace esto difieren, desde la fotosíntesis hasta la quema de carbohidratos ", dice Alberto Santos Delgado, quien durante los estudios trabajó en el Centro de Investigación de Proteínas de la Fundación Novo Nordisk.
Los investigadores han utilizado una tecnología avanzada llamada espectrometría de masas para estudiar las 100 especies. La tecnología les permitió duplicar el número de proteínas confirmadas experimentalmente.
Investigaciones previas han pronosticado cuántas proteínas existen y cuáles existen en función del código genético y los cálculos bioinformáticos. Sin embargo, el nuevo mapeo de proteínas ha proporcionado datos reales sobre la existencia de una gran cantidad de proteínas nuevas.
El aprendizaje automático puede revelar nuevas correlaciones
'Nuestro trabajo conectando la proteómica cuantitativa basada en la espectrometría de masas con los recursos de la base de datos ha dado como resultado un conjunto de datos de ocho millones de puntos de datos con 53 millones de interconexiones. Pusimos todos los datos a disposición del público, permitiendo que otros investigadores lo utilicen para identificar nuevas correlaciones.Las nuevas tecnologías habilitadas por el aprendizaje automático están en aumento y esperamos que se beneficien del conjunto de datos grande y uniforme que proporcionamos públicamente ', dice el estudiante de doctorado Johannes Mueller del Instituto de Bioquímica Max Planck.
Los investigadores de la Universidad de Copenhague se centraron en el procesamiento de datos y el análisis bioinformático, mientras que los investigadores del Instituto de Bioquímica Max Planck en Munich se centraron en la espectrometría de masas.
En el sitio web Proteomes of Life, los investigadores hicieron públicos todos los datos del proyecto.
El estudio fue financiado por la Sociedad Max Planck para el Avance de la Ciencia, el programa Horizonte 2020 de la UE y la Fundación Novo Nordisk.
Fuente de la historia :
Materiales proporcionado por Universidad de Copenhague, Facultad de Ciencias Médicas y de Salud . Nota: El contenido puede ser editado por estilo y longitud.
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