En un estudio publicado recientemente en la revista científica G3: Genes, Genomas, Genética , investigadores de la Universidad de Ciencias de la Vida de Estonia, en colaboración con colegas de la Universidad de Turku, reunieron la perca euroasiática nombre en latín Perca fluviatilisEl genoma , que es tres veces más pequeño que el genoma humano, contiene alrededor de mil millones de nucleótidos y más de 23,000 genes.La perca investigada se originó en las aguas oscuras del lago Loosalu en medio de los pantanos del condado de Rapla.Los resultados de la investigación permiten a los científicos de todo el mundo comprender mejor el efecto de la selección natural en el genoma.
La perca euroasiática es una especie de pez muy común en Estonia y Eurasia. Su hábitat abarca desde las Islas Británicas hasta el Lejano Oriente ruso. La especie puede vivir y reproducirse con éxito en condiciones ambientales extremas. Por lo tanto, podemos encontrar la perca en oligotróficoslos lagos de agua clara, las aguas salobres del mar Báltico y los lagos ácidos de agua oscura donde otras especies de peces no pueden sobrevivir. Sin embargo, aún no se sabe qué tipo de mecanismos genéticos han ayudado a la perca a adaptarse a condiciones de vida tan diferentes.
La perca es un eslabón importante en la cadena alimentaria de los cuerpos de agua. Recientemente se descubrió que el pez rayado tiene un gran impacto en el ciclo de metano de los lagos. La perca puede reducir las emisiones de metano a los lagos casi diez veces por los cambios encadena alimentaria. Como el metano es un gas de efecto invernadero mucho más efectivo que el dióxido de carbono, la perca desempeña un papel importante en la reducción del calentamiento global. "Es por eso que es especialmente importante comprender los mecanismos de adaptación de la perca en lagos pantanosos pobres enoxígeno y rico en sustancias húmicas donde la emisión de metano es la más alta y la perca es a menudo la única especie de pez ", dijo el ictiólogo Anti Vasemägi, profesor de la Universidad Sueca de Ciencias Agrícolas e investigador principal de la Universidad de Ciencias de la Vida de Estonia, quien dirigióla investigación.
Según Vasemägi, el genoma ensamblado es un hito significativo tanto en el contexto estonio como internacional. "En comparación con las especies de peces previamente estudiadas, el genoma secuenciado por nosotros es de gran valor ya que utilizamos una metodología innovadora basada en el marcado separado de ADN largomoléculas y determinar la secuencia de las cortas ", describió Vasemägi. El científico dijo que la metodología aplicada permite secuenciar incluso genomas grandes de forma rápida, comparativamente barata y precisa, durante la cual la tarea extremadamente difícil de unir el genoma se divide en millones de menoresrompecabezas. Debido a esto, finalmente es posible llevar a cabo estudios que abarquen todo el genoma de diferentes especies de peces. Vasemägi agregó que la forma más fácil de comprender el tamaño del genoma es convertir sus medidas de manera comprensible a los humanos ".la longitud de un par de bases es de un milímetro, el genoma de la perca puede alcanzar desde Tartu hasta Berlín ", denotó, y agregó que el nLa tarea adicional para el grupo de investigación es mapear regiones del genoma, o publicaciones de kilómetros en la ruta de Tartu a Berlín que contienen rastros de selección natural ".
Además, la perca es una importante especie de pez explotada comercialmente y también un objetivo muy popular entre los pescadores recreativos. Debido a su delicioso sabor, su cultivo ha comenzado en muchos lugares de Europa ". La secuenciación del genoma de la perca permite a los científicos mapear elregiones del genoma que afectan la tasa de crecimiento de los peces, el momento de alcanzar la madurez sexual, la resistencia a las enfermedades y otras características acuícolas importantes ", explicó el profesor Riho Gross, presidente de la Cátedra de Acuicultura de la Universidad de Ciencias de la Vida de Estonia. Secuenciación del genoma de la percasimplificará estudios similares en América del Norte, donde un pariente cercano de nuestra perca, la perca amarilla nombre latino Perca flavescens está muy extendida. La secuenciación del genoma de la perca es solo el primer paso para comprender qué mecanismos evolutivos han hecho de la perca uno de los más exitosos yespecies de peces diseminadas en Eurasia templada, concluyó Vasemägi.
La investigación realizada fue apoyada por el Consejo de Investigación de Estonia IUT8-2 y la Academia de Finlandia.
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Materiales proporcionados por Consejo de Investigación de Estonia . Nota: El contenido puede ser editado por estilo y longitud.
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