La difusión es el proceso que permite que el color se propague a través del té, pero hay mucho más que eso: es también uno de los principios más fundamentales que subyace en el funcionamiento interno de las células vivas. La capacidad de las moléculas para moverse dentro o entre las célulasdetermina dónde, y si, pueden llevar a cabo su función. En consecuencia, la motilidad de las moléculas puede revelar mucho sobre sus tareas en el organismo vivo. Por lo tanto, los científicos están utilizando los llamados ensayos "FRAP" FRAP: Fluorescence Recovery AfterPhotobleaching para investigar la cinética de difusión, un método establecido hace más de 40 años.
El equipo interdisciplinario alrededor de Patrick Müller en el Laboratorio Friedrich Miescher de la Sociedad Max Planck en Tübingen, Alemania, tuvo una nueva versión de este tipo de experimento. En la revista Comunicaciones de la naturaleza llaman la atención sobre las limitaciones de las herramientas de análisis preexistentes para los ensayos FRAP, y ofrecen una alternativa flexible y precisa: su software de acceso abierto "PyFRAP".
En los ensayos FRAP, se mide el tiempo que las moléculas fluorescentes necesitan para reponer un área blanqueada, básicamente evaluando qué tan rápido un área de muestra oscura se vuelve brillante de nuevo. Sin embargo, la evaluación de las imágenes del microscopio resultantes es todo menos trivial: movimiento moleculardepende, entre otras cosas, de la forma del entorno. Si una estructura compleja se aproxima con geometrías demasiado simplificadas para facilitar el análisis, los coeficientes de difusión estimados pueden estar muy alejados de los valores reales. PyFRAP opera sin tales supuestos simplistas y en cambio toma más realismo,estructuras tridimensionales en cuenta. El programa simula numéricamente el experimento y utiliza algoritmos clásicos para ajustar las simulaciones a los datos medidos.
El Dr. Alexander Bläßle, autor principal de la publicación, y sus colegas han identificado una variedad de problemas potenciales con los métodos de análisis FRAP actuales y los han abordado durante el desarrollo de PyFRAP. Esta minuciosidad valió la pena: en comparación con los programas alternativos, PyFRAP ofrece particularmenteresultados confiables, especialmente en condiciones complicadas. Y sus condiciones iniciales flexibles también permiten evaluar los datos de iFRAP iFRAP: FRAP inverso, una alternativa relativamente nueva a FRAP que es menos dañina para las muestras delicadas.
Con la disponibilidad de un método de análisis más preciso, ahora podrían surgir nuevas aplicaciones para los ensayos FRAP o iFRAP. Los autores señalan que su software puede ayudar a explorar las interacciones entre las moléculas en los organismos vivos: por ejemplo, podría ayudar a determinar silas moléculas se ralentizan al interactuar con tal vez hasta ahora no descubierto compañeros de unión
PyFRAP tiene el potencial de establecerse como un nuevo programa de análisis estándar en investigación básica. En cualquier caso, ya proporciona un ejemplo impresionante de los beneficios de desafiar constantemente las estrategias establecidas y no estar satisfecho con soluciones simples pero menos precisas.
Software: el programa PyFRAP está disponible para descargar de forma gratuita en los siguientes enlaces :
Fuente de la historia :
Materiales proporcionados por Max-Planck-Gesellschaft . Nota: El contenido puede ser editado por estilo y longitud.
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