La mayor parte del genoma humano, el 98 por ciento, está formado por ADN, pero en realidad no codifica genes, las recetas que las células usan para construir proteínas. La gran mayoría de las mutaciones genéticas asociadas con el cáncer ocurren en estas regiones no codificantesdel genoma, pero no está claro cómo podrían influir en el desarrollo o el crecimiento del tumor. Ahora los investigadores de la Facultad de Medicina de la Universidad de California en San Diego y el Centro de Cáncer Moores han identificado cerca de 200 mutaciones en el ADN no codificante que juegan un papel funcional en el cáncer.de las mutaciones podría representar un nuevo objetivo en la búsqueda de medicamentos contra el cáncer.
El estudio se publica el 2 de abril en Genética de la naturaleza .
"La mayoría de las mutaciones relacionadas con el cáncer ocurren en regiones del genoma fuera de los genes, pero hay tantas de ellas que es difícil saber cuáles son realmente relevantes y cuáles son simplemente ruido", dijo el autor principal, Trey Ideker, PhD,profesor de la Facultad de Medicina de la UC San Diego y el Centro de Cáncer Moores. "Aquí, por primera vez, encontramos alrededor de 200 mutaciones en el ADN no codificante que son funcionales en el cáncer, y eso es alrededor de 199 más de lo que sabíamos antes".
Cuando los médicos y los científicos se refieren a los "genes del cáncer", generalmente hablan de los cientos de genes conocidos que, cuando mutan, claramente ayudan a impulsar la formación y el crecimiento del tumor. Cuando las mutaciones ocurren dentro de los genes, pueden detener la producción deproteína que el gen codifica, o que produce una versión que funciona mal. Para algunas de estas mutaciones genéticas relacionadas con el cáncer, existen terapias que se dirigen específicamente a la mutación para inhibir el crecimiento del tumor, un esfuerzo conocido como medicina personalizada o de precisión.
Ideker y su equipo se preguntaron sobre todas las otras mutaciones no codificantes en el cáncer. Casi ningún paciente con cáncer tiene las mismas mutaciones. Entonces, ¿qué están haciendo todas estas mutaciones? ¿Son solo ruido? ¿O son funcionales? ¿Y cómo funcionan?¿difieren entre pacientes?
Los investigadores habían intentado previamente buscar una respuesta en The Cancer Genome Atlas TCGA, la base de datos de información genómica de los Institutos Nacionales de Salud de más de 15,000 tumores humanos que representan muchos tipos de cáncer. Pero encontraron solo una mutación no codificante que parecíadesempeñar un papel en el cáncer se llama TERT.
Según Ideker, esos intentos anteriores simplemente no pudieron relacionar las mutaciones no codificantes con los comportamientos de las células cancerosas. Su equipo también confió en los datos de TCGA, comparando las muestras tumorales de 930 pacientes con cáncer con muestras de tejido normal de los mismos pacientes, peroesta vez los investigadores agregaron un paso adicional.
"La salsa secreta era buscar cambios en la expresión génica", dijo Ideker, quien también es fundador del Centro de Biología Computacional y Bioinformática de la UC San Diego y codirector de la Iniciativa del Mapa de Células del Cáncer.
Después de encontrar cerca de 200 mutaciones no codificantes que alteran la expresión génica, el equipo probó tres de ellas en el laboratorio. Replicaron la mutación no codificante en las células y observaron los cambios resultantes en la expresión génica.
"Un ejemplo que se destacó fue una mutación no codificante que afecta a un gen llamado DAAM1", dijo el primer autor Wei Zhang, PhD, investigador postdoctoral en el laboratorio de Ideker. "La activación de DAAM1 hace que las células tumorales sean más agresivas y puedan invadir mejortejidos circundantes "
A continuación, los investigadores intentarán combinar estas mutaciones no codificantes con mutaciones codificantes y determinar si hay subtipos: ciertos tipos de cáncer de mama que tienen un patrón común de mutaciones codificantes y no codificantes, por ejemplo. Su objetivoes encontrar acciones para esta información, como si un paciente tiene o no un patrón de mutación particular que puede proporcionar pistas de diagnóstico o pronóstico, o informar un enfoque particular de la terapia.
Fuente de la historia :
Materiales proporcionado por Universidad de California - San Diego . Original escrito por Heather Buschman, PhD. Nota: El contenido puede ser editado por estilo y longitud.
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