Nuevos hallazgos ayudarán a identificar las causas genéticas de los trastornos cerebrales: los investigadores de las Universidades de Basilea, Bonn y Colonia han presentado un catálogo sistemático de ubicaciones variables específicas en el genoma que influyen en la actividad genética en el hipocampo humano, como informan enel periódico Comunicaciones de la naturaleza .
Las diferencias individuales en la regulación génica contribuyen al desarrollo de numerosos trastornos multifactoriales. Por lo tanto, los investigadores están intentando aclarar la influencia de las variantes genéticas polimorfismos de un solo nucleótido o SNP en la expresión génica y en la modificación epigenética de secciones reguladoras del genoma.Metilación del ADN. El equipo alemán-suizo ha estudiado los determinantes genéticos de la expresión génica, así como el proceso de metilación del ADN en el hipocampo humano.
Tres millones de ubicaciones genómicas analizadas
Los investigadores han presentado un extenso catálogo de ubicaciones variables en el genoma, es decir, de los SNP, que afectan la actividad de los genes en el hipocampo humano. Específicamente, han analizado la influencia de más de tres millones de SNP, diseminadosen todo el genoma, sobre la actividad en genes cercanos y la metilación de secciones de ADN adyacentes.
Lo especial de su trabajo es que los investigadores utilizaron tejido de hipocampo recién congelado obtenido durante la cirugía en 110 pacientes con epilepsia resistente al tratamiento. Extrajeron ADN y ARN del tejido de hipocampo y, para todas las muestras obtenidas, utilizaron microchips para determinarvarios cientos de miles de SNP, así como el grado de metilación en varios cientos de miles de lugares conocidos como dinucleótidos CpG en el genoma. Entre otros análisis, midieron la expresión génica de más de 15,000 genes utilizando microchips de ARN.
Desarrollo de esquizofrenia
Los investigadores también demostraron las áreas preferidas en las que aparecen dinucleótidos CpG metilados de forma variable en el genoma, y pudieron asignarlos a elementos reguladores específicos, revelando un vínculo con trastornos cerebrales: una proporción significativa de los SNP identificados que influyen individualmente en el ADNLa metilación y la expresión génica en el hipocampo también contribuyen al desarrollo de la esquizofrenia, lo que subraya el papel potencialmente significativo que desempeñan los SNP con un efecto regulador en el desarrollo de trastornos cerebrales.
Los hallazgos del estudio facilitarán considerablemente la interpretación de la evidencia de asociaciones genéticas con trastornos cerebrales en el futuro. De los SNP involucrados en el desarrollo de trastornos cerebrales, muchos de los identificados en los últimos años se encuentran en la parte no codificante deel genoma. Por lo tanto, su efecto funcional en las células es poco claro.
Un factor importante en el éxito del proyecto fue la estrecha cooperación entre las universidades de Basilea, Bonn y Colonia. Esta colaboración cuenta con el apoyo del Consorcio IntegraMent, patrocinado por el Ministerio Federal de Educación e Investigación de Alemania y coordinado por el profesor Markus Nöthen dela universidad de Bonn.
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Materiales proporcionado por Universität Basel . Nota: El contenido puede ser editado por estilo y longitud.
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