Para muchos, la experiencia con Daphnia, comúnmente conocida como pulga de agua, termina en la escuela secundaria. El organismo a menudo se usa para experimentos científicos que exploran la toxicidad del agua, debido a su sensibilidad a los factores ambientales. Pero los microcrustáceos pequeños y transparentes se han estudiado intensamentedurante más de 150 años, y una nueva investigación publicada y presentada en la portada de la revista G3 revela que los científicos ahora pueden echar un vistazo más de cerca a su genoma.
Los investigadores han completado una secuencia de genoma nueva y mejorada de Daphnia pulex D. pulex , que proporciona una hoja de ruta más clara del genoma del organismo para que puedan identificar los genes y las vías que hacen que este organismo tenga tanto éxito en los ecosistemas de agua dulce.
Las poblaciones de Daphnia, apenas visibles a simple vista, se pueden encontrar en prácticamente todos los cuerpos de agua en pie en el planeta, incluida la Antártida. Evolucionan rápidamente y son maestros en responder a las condiciones en su entorno. Detectando las señales químicas deDepredadores cercanos, algunas especies de Daphnia desarrollan estructuras defensivas elaboradas, como espinas y cascos, que las hacen más difíciles de comer. Si bien los científicos han adquirido una comprensión profunda de lo que hacen estas pequeñas pulgas de agua para adaptarse a las condiciones variables, todavía no saben cómoellos lo hacen.
"Es por eso que un sistema como este es tan poderoso", dijo Michael E. Pfrender, director del Centro de Genómica y Bioinformática y profesor asociado en el Departamento de Ciencias Biológicas y la Iniciativa de Cambio Ambiental de la Universidad de Notre Dame ".Necesitamos esta infraestructura genómica para agregar al contexto ecológico que ya tenemos para comprender mejor cómo se adapta Daphnia. Debido a que tenemos una secuencia genómica mejorada, podemos obtener un catálogo de genes más preciso y al pensar en la respuesta al medio ambiente yseñales químicas, es importante activar y desactivar los genes y las vías. La imagen es mucho más completa que antes ".
Llamándolo el genoma "Arco de Portland" después de la Reserva Natural de Indiana donde se recolectó la Daphnia, la nueva asamblea llega seis años después de la primera secuencia de D. pulex en 2011. El estudio actual describe cómo los científicos utilizaron la última tecnología como parte de un proceso minucioso y metódico cuyo resultado condujo a la identificación de 18,440 genes.
D. pulex juega un papel vital en la ecología de la Tierra. Al alimentarse de algas y fitoplancton en aguas dulces permanentes, son los principales herbívoros en esos ambientes, las "vacas de los lagos", dijo Pfrender. También son forraje primario, transfiriendo todo esoenergía para los peces que los comen. Al comprender cómo las especies de Daphnia responden a elementos tóxicos como contaminantes industriales, floraciones de algas tóxicas o estrés térmico, los científicos pueden observar cómo los cambios ambientales causados por la agricultura y la escorrentía de carreteras o el calentamiento de las temperaturas y el cambio climático podrían afectarpoblaciones en lagos, ríos y cuerpos de agua permanentes.
"¿Qué le sucede a esta parte vital del ecosistema cuando las condiciones cambian muy rápidamente? ¿Qué genes permiten a algunas poblaciones hacer frente a estos cambios mientras que otras fallan?", Dijo Pfrender. "Eso es lo que queremos descubrir. Esta secuencia del genoma proporciona lakit de herramientas "
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Materiales proporcionado por Universidad de Notre Dame . Nota: El contenido puede ser editado por estilo y longitud.
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