Investigadores de la Universidad de Barcelona han desarrollado un método computacional más eficiente para identificar nuevas drogas. El estudio, publicado en la revista científica Química de la naturaleza , propone una nueva forma de enfrentar el descubrimiento de moléculas con actividad biológica.
Dado que se basa en un principio diferente, este método complementa las herramientas convencionales y permite avanzar en el camino del diseño racional de medicamentos. El investigador de ICREA, Xavier Barril, de la Facultad de Farmacia y Ciencias de los Alimentos y el Instituto de Biomedicina de la Universidad deBarcelona IBUB, ha liderado este proyecto, que cuenta con la participación del profesor Francesc Xavier Luque y el estudiante de doctorado Sergio Ruiz Carmona, miembros de la misma Facultad.
La mejora en la eficiencia y la efectividad en el descubrimiento de medicamentos es un objetivo clave en la investigación farmacéutica. En este proceso, el objetivo son moléculas que se pueden agregar a una proteína objetivo y modificar su comportamiento de acuerdo con las necesidades clínicas ". Todos los métodos actualespredecir si una molécula se unirá a la proteína deseada se basa en la afinidad, es decir, en la estabilidad termodinámica del complejo. Lo que estamos demostrando es que las moléculas tienen que crear complejos que sean estructuralmente estables, y que es posible distinguir entre activo yinactivo al observar qué interacciones específicas son difíciles de romper ", dice el profesor Xavier Barril.
Este enfoque se ha aplicado en un software que identifica moléculas con más posibilidades de unirse a la proteína objetivo. "El método permite seleccionar moléculas que pueden ser puntos de partida para crear nuevos fármacos", dice Barril. "Además, -continúa- el procesoes complementario con los métodos existentes y permite multiplicar cinco veces la eficiencia de los procesos actuales con precios computacionales más bajos. De hecho, lo estamos utilizando con éxito en varios proyectos en el campo del cáncer y las enfermedades infecciosas, entre otros ".
Una nueva visión para las drogas ligando de proteínas
Este trabajo presenta una nueva forma de pensar con respecto a la interacción ligando-proteína. "No observamos la situación de equilibrio, donde dos moléculas hacen las mejores interacciones posibles, pero también pensamos cómo se romperá el complejo, que se romperálos puntos son y cómo podemos mejorar el medicamento para hacerlo más resistente a la separación. Ahora tenemos que centrarnos en este fenómeno para comprenderlo mejor y ver si al crear modelos más complejos aún podemos mejorar nuestras predicciones ", dice el investigador.El equipo de la Universidad de Barcelona ya está utilizando este método, que está abierto a toda la comunidad científica.
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Materiales proporcionado por Universidad de Barcelona . Nota: El contenido puede ser editado por estilo y longitud.
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