Johannes Reiter, ex estudiante de doctorado en el grupo de Krishnendu Chatterjee en el Instituto de Ciencia y Tecnología de Austria IST Austria, es coautor de a Naturaleza documento sobre alteraciones genéticas que impulsan la progresión y la recaída del cáncer. Un equipo internacional de científicos de los EE. UU., Alemania y Austria identificó nuevos genes asociados con la leucemia linfocítica crónica a través del análisis de datos de secuenciación de alto rendimiento.
Conocer las alteraciones genéticas que proporcionan una ventaja selectiva a las células cancerosas es esencial para comprender la evolución del cáncer y proporciona la base para nuevas terapias. El equipo de científicos analizó los datos de secuenciación de todos los genes codificadores de proteínas en un genoma llamado todo-secuenciación del exoma de 538 pacientes con leucemia linfocítica crónica CLL. La CLL es el tipo de leucemia más común y ocurre principalmente en adultos.
Utilizando métodos sofisticados de análisis de datos, los científicos identificaron 44 genes que con frecuencia mutan en pacientes con CLL. Estas mutaciones se denominan "mutaciones conductoras": mientras las células cancerosas así como las células normales acumulan muchas mutaciones a medida que envejecen,las mutaciones conductoras son aquellas que realmente causan que el cáncer surja o crezca; mientras que las mutaciones pasajeras no tienen consecuencias funcionales para el crecimiento del cáncer.18 de estas 44 mutaciones conductoras han sido identificadas previamente, mientras que las 26 restantes son genes impulsores de CLL supuestos adicionales que potencialmente afectan el cáncer.Además, los investigadores encontraron 11 variaciones en el número de copias somáticas que estaban presentes más de lo esperado por casualidad. Los genes impulsores identificados afectan el procesamiento y la exportación de ARN, la actividad de MYC, un factor de transcripción que juega un papel en la apoptosis y la señalización de MAPK, una vía de señalización implicada en muchas formas de cáncer.
Además, los autores descubrieron características genéticas que contribuyen a una recaída de la enfermedad. La gran cantidad de muestras analizadas también les permitió inferir qué mutaciones impulsoras surgen temprano y cuáles surgen tarde. Así podrían estudiar la secuencia temporal típica del cánceravance y explore las relaciones evolutivas entre los genes impulsores. También se identificaron mutaciones que afectan el resultado clínico de la enfermedad. En particular, las mutaciones TP53, SF3B1 y RPS15 se asociaron con una supervivencia más corta sin progresión de los pacientes.
Este estudio muestra que los grandes conjuntos de datos de secuencia permiten el descubrimiento de nuevos genes asociados con el cáncer, así como el impacto de las mutaciones del gen conductor en la recaída y el resultado clínico.
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Materiales proporcionado por Instituto de Ciencia y Tecnología de Austria . Nota: El contenido puede ser editado por estilo y longitud.
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