En un análisis del impacto en el mundo real de una prueba pionera llamada secuenciación metagenómica de próxima generación mNGS, desarrollada por científicos de la UCSF para diagnosticar pacientes con condiciones neurológicas inflamatorias misteriosas, se demostró que la técnica identifica las infecciones mejor que cualquier clínica clínica estándarmétodo.
"La causa infecciosa de la mitad de los casos de meningitis y encefalitis no se diagnostica en los hospitales de todo el país, y estos pacientes gravemente enfermos necesitan urgentemente una mejor herramienta de prueba", dijo Charles Chiu, MD, PhD, profesor de medicina de laboratorioy medicina en UCSF y autor principal del nuevo estudio. A diferencia de las pruebas convencionales, que a menudo son impulsadas por las corazonadas de los médicos, la prueba mNGS ofrece un enfoque imparcial que puede detectar casi todos los posibles patógenos bacterias, virus, hongos y parásitospresente en el líquido cefalorraquídeo de los pacientes, dando a los médicos una dirección clara para el tratamiento.
El estudio, publicado el 13 de junio de 2019 en el New England Journal of Medicine , se estableció para inscribir solo los casos más difíciles. Para calificar, un paciente tuvo que ser hospitalizado con una enfermedad neurológica aguda sin diagnóstico concluyente. El estudio incluyó 204 pacientes pediátricos y adultos, en su mayoría de California, que tenían meningitis inflamación del revestimiento que rodea el cerebro, encefalitis inflamación del cerebro mismo o mielitis inflamación de la médula espinal.
La prueba encontró muchas de las mismas infecciones identificadas por los métodos convencionales de análisis de laboratorio, que generalmente buscan patógenos de uno en uno, y requieren que los médicos sepan lo que están buscando para tener éxito. Pero también encontró 13 infecciones que no se detectaronsegún todas las pruebas convencionales, como un caso de infección por el virus de la encefalitis de San Luis, que no se había visto en California desde 1986. Y en más de la mitad de esos casos, el diagnóstico de mNGS fue indispensable para guiar el tratamiento de estos pacientes.En un caso de infección por el virus de la hepatitis E que se había pasado por alto en las pruebas convencionales, el diagnóstico exitoso de mNGS probablemente evitó que el paciente tuviera que someterse a un trasplante de hígado.
"La prueba de mNGS generalmente se ordena como prueba de último recurso, y terminamos inscribiendo a los pacientes más difíciles de diagnosticar", dijo Chiu, también director del Centro de Diagnóstico y Descubrimiento Viral UCSF-Abbott. "Todas las pruebas de microbiología convencionales combinadasrinden diagnósticos en menos del 50 por ciento de estos pacientes. Hemos demostrado que una sola prueba - mNGS - puede hacer una abolladura significativa en ese número ".
En total, la prueba identificó 32 infecciones del sistema nervioso en 31 pacientes. Además de los 13 diagnósticos realizados solo por mNGS, la nueva tecnología confirmó 19 infecciones que también habían sido diagnosticadas por pruebas convencionales.
Menos de la mitad de los casos de meningitis y encefalitis son causados por infecciones. La mayoría del resto son el resultado de reacciones autoinmunes, en las que el propio cuerpo del paciente ataca el sistema nervioso. Sin embargo, las dos afecciones requieren tratamientos muy diferentes: supresión de la inmunidaden un paciente con una infección puede ser dañino, y administrar antibióticos en un caso de enfermedad autoinmune es ineficaz y puede promover innecesariamente la resistencia antimicrobiana, por lo que lo primero que debe saber un médico al tratar a esos pacientes es qué categoría de enfermedad inflamatoria tienen.
"Los pacientes con encefalitis infecciosa y no infecciosa pueden ser clínicamente indistinguibles unos de otros", dijo Michael Wilson, MD, profesor asociado de neurología en la UCSF y coautor del artículo, junto con el coordinador del estudio Hannah Sample. "Tener unUna prueba de base amplia que determina que la infección o descarta la infección realmente puede ayudar a estos casos que se encuentran en áreas grises entre la infección y no ".
Sin embargo, la nueva prueba no es perfecta y hubo 26 infecciones que no pudo diagnosticar. En la mayoría de estos casos, el ADN del patógeno no estaba presente en el líquido cefalorraquídeo, lo que requirió el análisis de un tipo de muestra diferente, comotejido de un absceso cerebral, o el uso de un método de prueba indirecto, como la prueba de anticuerpos, para hacer el diagnóstico. Un ejemplo en el estudio fue la infección por el virus del Nilo Occidental, que a menudo no se puede identificar secuenciando el material genético viral que se encuentra en el líquido cefalorraquídeo porqueviene y va muy rápido
En algunos casos, mNGS encontró indicios de infecciones como la tuberculosis que dejan pocos rastros en el líquido cefalorraquídeo. Pero a pesar de que estas infecciones no se detectaron a niveles suficientemente altos como para informar de manera definitiva, sabiendo que están presentes, incluso en pequeñas cantidades, podríatodavía ayudan a los médicos ordenándoles que soliciten otra prueba de diagnóstico para confirmar si el patógeno estaba presente.
Fuente de la historia :
Materiales proporcionado por Universidad de California - San Francisco . Original escrito por Laura Kurtzman. Nota: El contenido puede ser editado por estilo y longitud.
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