Investigadores financiados por los Institutos Nacionales de Salud han completado un análisis genómico detallado, conocido como PanCancer Atlas, en un conjunto de datos de información molecular y clínica de más de 10,000 tumores que representan 33 tipos de cáncer.
"Este proyecto es la culminación de más de una década de trabajo innovador", dijo el director de NIH, Francis S. Collins, MD, Ph.D. "Este análisis proporciona a los investigadores del cáncer una comprensión sin precedentes de cómo, dónde y por qué surgen los tumores enhumanos, lo que permite ensayos clínicos mejor informados y tratamientos futuros ".
The PanCancer Atlas, publicado como una colección de 29 artículos en un conjunto de celda revistas, resume el trabajo realizado por The Cancer Genome Atlas TCGA, una colaboración de múltiples instituciones iniciada y apoyada por el Instituto Nacional de Investigación del Genoma Humano NHGRI y el Instituto Nacional del Cáncer NCI, ambos parte de los NIHEl programa, con más de $ 300 millones en financiamiento total, involucró a más de 150 investigadores en más de dos docenas de instituciones en América del Norte.
"TCGA fue el primer proyecto de su escala para caracterizar, a nivel molecular, el cáncer en una amplia gama de tipos de cáncer", dijo Carolyn Hutter, Ph.D., directora de la División de Ciencias del Genoma del NHGRI y el equipo del NHGRIlíder de TCGA. "En la infancia del proyecto, hace 10 años, ni siquiera era posible, y mucho menos a tal escala, hacer los tipos de caracterización y análisis que se estaban proponiendo. Fue un proyecto enormemente ambicioso".
"El esfuerzo del PanCancer Atlas complementa los más de 30 artículos específicos de tumores que han sido publicados por TCGA en la última década y amplía el trabajo anterior sobre el cáncer que se publicó en 2013", dijo Jean Claude Zenklusen, Ph.D.,director de la Oficina del Programa TCGA en NCI.
El proyecto se centró no solo en la secuenciación del genoma del cáncer, sino también en diferentes tipos de análisis de datos, como la investigación de perfiles de expresión de genes y proteínas, y su asociación con datos clínicos y de imágenes.
El Atlas PanCancer se divide en tres categorías principales, cada una de las cuales se basa en un documento de resumen que resume los hallazgos centrales del tema. Los temas principales incluyen células de origen, procesos oncogénicos y vías oncogénicas. Varios artículos complementarios informan exploraciones en profundidad detemas individuales dentro de estas categorías.
En el primer artículo de resumen, los autores resumen los hallazgos de un conjunto de análisis que utilizó una técnica llamada agrupación molecular, que agrupa los tumores por parámetros como los genes que se expresan, la anomalía del número de cromosomas en las células tumorales y las modificaciones del ADN.los hallazgos sugieren que los tipos de tumores se agrupan por sus posibles células de origen, un resultado que se suma a nuestra comprensión de cómo el tejido tumoral de origen influye en las características de un cáncer y podría conducir a tratamientos más específicos para varios tipos de cáncer.
El segundo documento de resumen presenta una visión amplia de los hallazgos de TCGA sobre los procesos que conducen al desarrollo y la progresión del cáncer. Específicamente, los autores observaron que los hallazgos identificaron tres procesos oncogénicos críticos: mutaciones, tanto de línea germinal heredadas como somáticas adquiridos; la influencia del genoma y el epigenoma subyacentes del tumor en la expresión de genes y proteínas; y la interacción de las células tumorales e inmunes. Estos hallazgos ayudarán a priorizar el desarrollo de nuevos tratamientos e inmunoterapias para una amplia gama de cánceres.
El documento de resumen final detalla las investigaciones de TCGA sobre las alteraciones genómicas en las vías de señalización que controlan la progresión del ciclo celular, la muerte celular y el crecimiento celular, revelando las similitudes y diferencias en estos procesos en una variedad de cánceres. Sus hallazgos revelan nuevos patrones devulnerabilidades potenciales del cáncer que ayudarán en el desarrollo de terapias combinadas y medicina personalizada.
La colección completa de artículos que componen el PanCancer Atlas está disponible a través de un portal en cell. Com. Además, a medida que finalice el esfuerzo de TCGA de una década, habrá un simposio de tres días, TCGA Legacy: Multi-Omic Studies inCancer, en Washington, DC, del 27 al 29 de septiembre de 2018, que discutirá el futuro de los estudios sobre el cáncer a gran escala, con una sesión centrada en el Atlas PanCancer. La reunión presentará los últimos avances en la arquitectura genómica del cáncer y un escaparateprogreso reciente hacia la focalización terapéutica.
Fuente de la historia :
Materiales proporcionado por NIH / Instituto Nacional de Investigación del Genoma Humano . Nota: el contenido se puede editar por estilo y longitud.
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