Un nuevo modelo estadístico ha permitido a los investigadores identificar 27 genes nuevos que se cree que previenen la formación de cáncer, en un análisis de más de 2000 tumores en 12 tipos de cáncer humano. Los hallazgos podrían ayudar a crear nuevos tratamientos contra el cáncer dirigidos a estos genes y abrirseotras vías de investigación del cáncer.
"Usando este poderoso kit de herramientas, hemos descubierto genes supresores de tumores raros que cuando se pierden en las células mutadas, causan cáncer", dice Jonas Demeulemeester, primer autor conjunto del artículo e investigador en el Instituto Francis Crick. "Esto podría allanar elforma para el desarrollo de tratamientos personalizados contra el cáncer "
La investigación, publicada en Comunicaciones de la naturaleza , fue dirigido por científicos del Instituto Francis Crick y la Universidad de Lovaina, en colaboración con la Universidad de Chicago y la Universidad de Oslo.
Tenemos dos copias de genes supresores de tumores en todas nuestras células para evitar que se vuelvan cancerosas. Similar a los dos juegos de frenos en una bicicleta, ambas copias del gen deben perderse para liberar los 'frenos'en la formación de tumores.
Estas supresiones de copias de genes dobles pueden proporcionar pistas para los genes supresores de tumores en el cáncer. Sin embargo, las muestras de cáncer normalmente contienen células sanas y células cancerosas en proporciones desconocidas, lo que hace difícil determinar si solo una copia o ambas copias del gense han perdido en las células cancerosas. Además, puede ser difícil distinguir entre deleciones dañinas de genes supresores de tumores y deleciones no dañinas de otros genes en sitios frágiles a lo largo del genoma.
El equipo desarrolló herramientas computacionales para superar estos problemas y las utilizó para analizar 2,218 tumores de 12 tipos de cáncer, incluidos los cánceres de mama, pulmón e intestino. Al determinar las proporciones relativas de células cancerosas y sanas en cada muestra, podrían calcular el númerode copias de cada gen en las células cancerosas. Este análisis reveló 96 regiones del genoma humano que con frecuencia se pierden durante el desarrollo del tumor.
El análisis también reveló que las deleciones de genes supresores de tumores dañinos tienen una "huella de ADN" diferente a las eliminaciones no dañinas, que tienden a ser mucho más pequeñas. Esto permitió a los investigadores clasificar las 96 deleciones, revelando 16 genes supresores de tumores previamente conocidos,y 27 nuevos. Anteriormente se sospechaba que algunos de ellos contribuían al desarrollo del cáncer, mientras que otros eran completamente nuevos.
"Nuestro estudio demuestra que los genes supresores de tumores raros se pueden identificar a través del análisis a gran escala del número de copias de genes en muestras de cáncer", dice Peter Van Loo, autor principal del artículo y líder de grupo en el Instituto Francis Crick.
"La genómica del cáncer es un área de investigación en crecimiento, y las herramientas computacionales que utilizamos son una forma poderosa de encontrar nuevos genes involucrados en el cáncer"
Los nuevos genes supresores de tumores candidatos identificados en este estudio pueden ser investigados por científicos en el laboratorio para comprender su mecanismo de acción y tratar de encontrar objetivos farmacológicos.
El artículo 'Análisis de cáncer de pan de deleciones homocigóticas en tumores primarios descubre supresores de tumores raros' se publica en Comunicaciones de la naturaleza .
Fuente de la historia :
Materiales proporcionado por El Instituto Francis Crick . Nota: El contenido puede ser editado por estilo y longitud.
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