Los científicos que trabajan para controlar un brote humano del virus de la viruela del simio MXPV en Nigeria realizaron una secuenciación genética de muestras de pacientes, revelando que el brote probablemente se originó en una fuente dentro del país. Sus resultados enfatizan el valor de la vigilancia local para la detección temprana deefectos secundarios virales y la necesidad de una caracterización genética avanzada para ayudar a determinar los orígenes de los brotes.
"Con base en nuestros hallazgos, parece que el caso índice del brote actual en Nigeria no fue importado, sino que probablemente se originó a partir de un evento de derrame o eventos que involucran a reservorios", dijo Gustavo Palacios, Ph.D., quien encabeza elCentro de Ciencias del Genoma del Instituto de Investigación Médica de Enfermedades Infecciosas del Ejército de EE. UU. USAMRIID y un equipo multinacional de colaboradores publicaron su análisis en una carta publicada en línea esta semana en la revista Las enfermedades infecciosas de The Lancet .
Según la Organización Mundial de la Salud, se informaron 172 casos sospechosos y 61 confirmados de MPXV, incluida una muerte, en diferentes partes de Nigeria entre el 4 de septiembre y el 9 de diciembre de 2017. Antes de este brote, solo se habían registrado diez de estos casosreportado en la región entre 1971 y 1978. Debido a este lapso y los casos recientes en la cuenca del Congo, el origen del último brote nigeriano necesitaba ser identificado, al igual que si el brote fue el resultado de un evento de propagación zoonótica local o importaciónde otro país endémico.
El esfuerzo de investigación fue apoyado por el Instituto Pasteur en Dakar IPD en Senegal y la Agencia de Reducción de Amenazas de Defensa de EE. UU. Se proporcionó equipo de secuenciación a IPD, donde se realizó la secuenciación, mediante la Adquisición Dirigida de Capacidades de Aumento de Materiales de Referencia TARMAC y la Oficina de Aseguramiento de Productos Biológicos de Defensa DBPAO a través de una adjudicación de orden de tareas al Instituto Nacional de Investigación Estratégica.Los equipos de control de brotes estaban compuestos por personal del Ministerio de Salud del Estado de Bayelsa, Hospital de Enseñanza de la Universidad Delta del Níger, Laboratorio de Epidemiología y Laboratorio de NigeriaPrograma de capacitación y el Centro de Nigeria para el Control de Enfermedades.
Según Bruce Goodwin, director de DBPAO, la capacidad de secuencia establecida en IPD bajo la iniciativa TARMAC permitió un tiempo de respuesta significativamente mejorado, menos de dos meses desde la recepción de la muestra hasta los resultados que podrían ser utilizados por los profesionales de la salud pública que trabajan paracontrolar el brote. Este esfuerzo demuestra la importancia de la capacidad de secuenciación en el país junto con los protocolos apropiados y el apoyo para producir datos procesables. Los datos producidos a partir de este evento se utilizaron para validar los ensayos DBPAO existentes, un proceso bajo TARMAC que garantiza que DBPAO sea capazpara detectar enfermedades de relevancia biodefensa.
El virus de la viruela del simio se identificó por primera vez en 1958 y ha causado brotes humanos esporádicos en África central y occidental, con una tasa de mortalidad de entre uno y diez por ciento. Recientemente, se han producido brotes de MPXV en Sudán 2005, la República del Congo y la República Democráticadel Congo 2009 y la República Centroafricana 2016.
Según Palacios, el análisis genético del "árbol genealógico" del virus indica que los aislamientos descritos en la carta se agruparon más estrechamente a un genoma aislado de un caso humano en Ihie, estado de Abia, Nigeria en 1971, que está relativamente cerca delepicentro del brote actual.
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Materiales proporcionados por Instituto de Investigación Médica del Ejército de EE. UU. De Enfermedades Infecciosas . Nota: El contenido puede ser editado por estilo y longitud.
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