Las complejas redes de señalización que utilizan las bacterias para adaptarse a sus entornos se han vuelto más claras tras una nueva investigación.
Los investigadores del Centro John Innes utilizaron un estudio de la bacteria promotora del crecimiento de las plantas Pseudomonas fluorescens para desarrollar un método de análisis avanzado que, esperan, aumentará nuestra capacidad para comprender las enfermedades de las plantas y los seres humanos.
Hasta hace poco, las investigaciones sobre la señalización bacteriana tendían a examinar diferentes aspectos de la regulación genética de forma aislada. Basándose en estos enfoques individuales, el equipo de John Innes utilizó una variedad de técnicas de laboratorio, computacionales y matemáticas para integrar datos obtenidos de múltiples métodos microbiológicos diferentes.experimentos.
Este enfoque les ha permitido construir un 'mapa de señalización' completo para la proteína bacteriana clave Hfq, que controla la virulencia y las respuestas al estrés en muchas especies de importancia clínica y agrícola.
El Dr. Jacob Malone, líder del proyecto asociado con el trabajo, explicó: "Nuestra técnica nos permite seguir cada gen y proteína en una célula bacteriana, y decir cómo cambia y a qué nivel ocurre ese cambio, en respuesta a una señal determinadaentrada.
"Estamos usando los mismos conjuntos de datos que en estudios anteriores, pero hemos desarrollado una forma de integrar los datos usando matemáticas y programación. Si considera los elementos individuales de una película: la fotografía, la banda sonora y el guión; combinándolosobtienes una película completa, algo mayor que la suma de las partes. Este es el mismo principio, solo que con la genética ".
Los hallazgos del equipo, publicados en Fronteras en microbiología Analyzing the Complex Regulatory Landscape of Hfq - an Integrative, Multi-Omics Approach, Grenga, L.et al.2017 promete cambiar la forma en que investigamos las redes de señalización bacteriana y mejorará nuestra comprensión de cómo las bacterias interactúan consus entornos y median infecciones.
"La gente ha analizado los datos en más de un nivel antes, pero no en esta profundidad", dijo el Dr. Malone. "En última instancia, nos gustaría que la gente considere abordar los datos de esta manera de forma rutinaria".
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Materiales proporcionado por Centro John Innes . Nota: el contenido se puede editar por estilo y longitud.
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