Los investigadores que utilizan la secuenciación de ADN para perfilar la resistencia a los antibióticos en la infección han logrado un tiempo de respuesta de 'muestra a respuesta' de menos de cuatro horas para infecciones del tracto urinario ITU.
La Universidad de East Anglia UEA está investigando el dispositivo nanopore MinION como una forma de acelerar la investigación de infecciones, incluidas las infecciones urinarias, una de las razones más comunes por las que a los pacientes se les recetan antibióticos.
Los métodos de cultivo tradicionales tardan de dos a tres días en caracterizar las bacterias y probar sus resistencias antimicrobianas a partir de una muestra de orina. Los primeros resultados del método del grupo UEA mostraron que el dispositivo Oxford Nanopore Technologies puede caracterizar las bacterias y predecir sus resistencias antimicrobianas en solo 12 horas a partir deuna muestra de orina
Esto se ha reducido a tan solo cuatro horas, como se publicó en el Revista de quimioterapia antimicrobiana .
Si bien la mayoría de las infecciones urinarias son leves, los casos graves pueden conducir a la hospitalización. En el peor de los casos, las bacterias pueden ingresar al torrente sanguíneo causando urosepsis, una afección potencialmente mortal. En este caso, los antibióticos son vitales y deben administrarse con urgencia.
Una predicción más rápida de si la infección urinaria es causada por un tipo de bacteria altamente resistente permitirá una adaptación precisa del tratamiento. El paciente recibirá un antibiótico que seguramente será activo contra su patógeno, y el recurso antibiótico limitado de la sociedad se manejará mejorEsto ayudará en la lucha contra el aumento de la resistencia a los antibióticos, uno de los mayores desafíos que enfrenta la sociedad hoy en día.
Como se destacó en el informe O'Neill en mayo de este año, el uso excesivo de antimicrobianos y el aumento resultante en la resistencia a los antibióticos podría, si todos los antibióticos fallan, conducir a la pérdida de 10 millones de vidas al año para 2050 si no se toman medidasEste informe encargado por el gobierno subraya el potencial de los diagnósticos rápidos para mejorar tanto el tratamiento como la administración de antibióticos y pidió a los gobiernos de los países más ricos que "ordenen ahora que para 2020, todas las recetas de antibióticos deberán ser informadas por-fecha de información de vigilancia y una prueba de diagnóstico rápido donde exista ".
El profesor David Livermore de la Escuela de Medicina de Norwich de la UEA dijo: "Identificar los patógenos específicos y la resistencia a los antibióticos lo más rápido posible es la clave para reducir el número de pacientes que están 'sobre tratados' con antibióticos de amplio espectro mientras esperan que lleguen los resultadosdesde el micro laboratorio, un proceso que actualmente lleva un par de días '.
"Este enfoque de 'bombardeo de alfombra' -de dar un antibiótico de amplio espectro mientras espera resultados- conduce a una administración de antibióticos deficiente. Es vital que avancemos más allá. La forma de hacerlo radica en acelerar la investigación de laboratorio. De esa manera, el tratamiento se puede refinar antes. Esto beneficiará al paciente, que recibe un antibiótico eficaz, y a la sociedad, cuyo stock de antibióticos en disminución se maneja mejor ".
Los hallazgos publicados hoy mostraron que la secuenciación de nanoporos MinION puede acelerar significativamente el diagnóstico y el perfil de resistencia, identificando patógenos y genes de resistencia adquiridos correctamente, sin cultivo.
El Dr. Justin O'Grady de la Escuela de Medicina de Norwich dijo: "Este estudio es el primero en utilizar la secuenciación MinION para diagnosticar rápidamente los patógenos y la resistencia a los antimicrobianos en muestras clínicas, sin aumentarlas. Mejoras en la tecnología de secuenciación, el análisis de datos y la preparación de muestras significanHemos reducido el tiempo de respuesta a cuatro horas.
"Obtener resultados tan rápido permitiría a los médicos ajustar los antimicrobianos muy temprano, incluso antes de administrar la segunda dosis; la mayoría de los antibióticos se administran una vez cada ocho horas".
En el estudio, se extrajeron células humanas de las muestras de orina de los pacientes, luego las bacterias se recuperaron y su ADN fue secuenciado por MinION. Las secuencias se analizaron y los resultados se compararon con el cultivo estándar y las pruebas de sensibilidad a antibióticos.
El Dr. O'Grady dijo: "Tanto el tipo de bacteria como los genes de resistencia adquiridos se identificaron de manera confiable, de acuerdo con las pruebas de laboratorio convencionales".
"Sin embargo, los desafíos persisten. Actualmente, el enfoque se adapta mejor a los casos difíciles, pero mejorar la administración de antibióticos en los hospitales requiere que se implementen nuevos diagnósticos de forma generalizada.
"Nuestro método actualmente requiere orina muy infectada y nuestro análisis rápido aún no puede predecir esas resistencias que surgen por mutación: cambios en los genes existentes. Pero la tecnología se está desarrollando rápidamente y esperamos superar estas limitaciones en el futuro cercano"
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Materiales proporcionado por Universidad de East Anglia . Nota: El contenido puede ser editado por estilo y longitud.
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