Las infecciones del tracto urinario ITU podrían tratarse de manera más rápida y eficiente utilizando un dispositivo de secuenciación de ADN del tamaño de una memoria USB, según una investigación de la Universidad de East Anglia.
Los investigadores utilizaron un nuevo dispositivo llamado MinION para realizar la secuenciación de nanoporos para caracterizar las bacterias de las muestras de orina cuatro veces más rápido que con los métodos tradicionales de cultivo de bacterias.
El nuevo método también puede detectar la resistencia a los antibióticos, lo que permite que los pacientes sean tratados de manera más efectiva y mejora la administración de la disminución de las reservas de antibióticos.
Los hallazgos se darán a conocer hoy en una conferencia médica internacional de cuatro días en San Diego, organizada conjuntamente por la Conferencia Interscience de Agentes Antimicrobianos y Quimioterapia de la Sociedad Estadounidense de Microbiología ICAAC y la Sociedad Internacional de Quimioterapia ICC.
El profesor David Livermore, de la Escuela de Medicina de Norwich de la UEA, dijo: "Las infecciones del tracto urinario se encuentran entre las razones más comunes para recetar antibióticos. La mayoría son leves y solo afectan el tracto urinario inferior, pero algunas son más problemáticas. Estas 'ascendentes'Las infecciones urinarias causan una carga creciente de hospitalizaciones, principalmente de pacientes de edad avanzada.
"En el peor de los casos, la infección se derrama en el torrente sanguíneo, dando lugar a una afección llamada urosepsis, que puede ser fatal. Hubo más de 30,000 casos de Escherichia coli infección del torrente sanguíneo registrada en Inglaterra en 2014, principalmente con un origen urinario.
"Los antibióticos son vitales, especialmente si las bacterias han entrado en el torrente sanguíneo, y deben administrarse con urgencia. Pero desafortunadamente toma dos días cultivar las bacterias en el laboratorio y probar qué antibióticos las matan.
"Como resultado, los médicos deben recetar una amplia gama de antibióticos, dirigidos a las bacterias con mayor probabilidad de ser responsables, y luego ajustar el tratamiento una vez que se obtengan los resultados del laboratorio.
"Esto significa que algunos pacientes reciben un tratamiento excesivo, lo que, por supuesto, contribuye al problema de la resistencia a los antibióticos. Pero también significa que un número creciente de pacientes con bacterias que son resistentes incluso a una amplia gama de medicamentos no reciben tratamiento.A veces esto puede ser fatal.
"Este enfoque de 'bombardeo de alfombras' representa una mala administración de los antibióticos, y es vital que avancemos más allá. La forma de hacerlo radica en acelerar la investigación de laboratorio, para que el tratamiento se pueda refinar antes, beneficiando al paciente, que recibeun antibiótico efectivo, y una sociedad, cuyo stock decreciente de antibióticos se maneja mejor "
El equipo de investigación usó un nuevo dispositivo pequeño de secuenciación de ADN llamado Nanopore MinION de Oxford Nanopore Technologies para investigar las infecciones urinarias rápidamente, sin cultivar la bacteria.
El Dr. Justin O'Grady, también de la Escuela de Medicina Norwich de la UEA, dijo: "Descubrimos que este dispositivo, que es del tamaño de una memoria USB, podía detectar la bacteria en la orina muy infectada y proporcionar su secuencia de ADN en solo12 horas. Esto es un cuarto del tiempo necesario para la microbiología convencional.
"Tanto el tipo de bacteria como sus genes de resistencia adquiridos se identificaron de manera confiable, de acuerdo con los perfiles de resistencia encontrados por las pruebas de laboratorio convencionales
"Resultados rápidos como estos permitirán refinar el tratamiento de un paciente mucho antes, y eso es bueno para el paciente, que recibe el antibiótico" correcto "y para la sociedad, que puede manejar o" administrar "su limitadosuministro de antibióticos.
"Esta tecnología es rápida y capaz no solo de identificar las bacterias en las infecciones urinarias, sino también de detectar la resistencia a los medicamentos en el punto de necesidad clínica".
"Aún quedan desafíos por superar. Actualmente, el enfoque se adapta mejor a los casos difíciles, mientras que mejorar la administración de antibióticos en los hospitales requiere que se implementen nuevos diagnósticos ampliamente.
"Nuestro método actualmente solo funciona con orina muy infectada y aún no puede predecir las resistencias que surgen por la mutación - cambios en los genes existentes - en lugar de la adquisición de nuevos genes de resistencia. Sin embargo, la tecnología se está desarrollando rápidamente, con progresivomejoras incluso durante nuestros estudios, y es probable que se puedan superar estas limitaciones.
"Es crucial que los superemos, porque el antiguo enfoque de usar una gama cada vez más amplia de antibióticos ya no es viable, dada la escasez de nuevos medicamentos y la creciente diversidad y complejidad de las bacterias resistentes a los antibióticos", agregó..
Katarzyna Schmidt y el Dr. Justin O'Grady presentarán el 19 de septiembre en ICAAC / ICC 2015 'Secuenciación de nanoporos MinION para identificar patógenos y genes de resistencia directamente de muestras de orina'
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Materiales proporcionado por Universidad de East Anglia . Nota: El contenido puede ser editado por estilo y longitud.
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