Alrededor de 10 millones de puntos de variación genética están dispersos en una molécula de ADN, y esas variaciones nos hacen quienes somos como individuos. Pero en algunos casos, esas variantes contribuyen a las enfermedades, y es un gran desafío para los científicos distinguir entre inofensivovariantes y aquellas que son potencialmente peligrosas para nuestra salud.
Ahora, los investigadores de la Facultad de Medicina de la Universidad de Washington en St. Louis han desarrollado una nueva técnica para crear de manera barata y rápida innumerables conjuntos de fragmentos de ADN que detallan todas las posibles variantes genéticas en un tramo particular de ADN. Al estudiar dichos fragmentos de ADN, los científicospuede distinguir más fácilmente entre las variantes genéticas relacionadas con la enfermedad y las que son inocuas.
Los hallazgos, publicados el 3 de octubre en Métodos de la naturaleza , permita a los investigadores crear conjuntos de variantes de ADN en un solo día por unos pocos cientos de dólares. Los métodos actuales tardan hasta una semana y cuestan decenas de miles de dólares.
"Como neuróloga pediátrica que realiza muchos estudios genéticos de niños con discapacidades del desarrollo, frecuentemente escanearé el genoma completo de un paciente en busca de variantes genéticas", dijo Christina Gurnett, MD, PhD, autora principal del estudio y profesora asociada deneurología y pediatría: "A veces encuentro una variante conocida que causa una enfermedad en particular, pero la mayoría de las veces encuentro variantes genéticas que nadie ha visto antes, y esos resultados son muy difíciles de interpretar".
En el pasado, los científicos probaron el efecto de las variantes genéticas una por una, un proceso laborioso. En un solo punto de la secuencia de ADN, reemplazaron la letra de ADN correcta, una A, T, C o G, por unade las otras tres opciones. Luego, tradujeron esa secuencia de ADN en una proteína y evaluaron si la proteína mutada se comportó de manera diferente a la original.
Más recientemente, los investigadores han comenzado a crear conjuntos de cientos de variantes en las que se cambia cada letra de una secuencia de ADN en particular, y luego prueban el conjunto de una vez. Sin embargo, estos estudios se han visto limitados por el alto costo de crearlos.conjuntos
El investigador postdoctoral Gabriel Haller, PhD, que trabajaba en el laboratorio de Gurnett, se dio cuenta de que podía aprovechar las técnicas y herramientas de laboratorio comunes para crear conjuntos de variantes de ADN sin el costoso equipo y reactivos que elevaron el precio.
Haller copió una secuencia de ADN usando las cuatro letras de ADN estándar y una letra no estándar conocida como inosina. Cada copia de la secuencia era idéntica, excepto una inosina, que se encontraba en un lugar aleatorio y servía como marcador de posición. Luego, reemplazóla inosina con una de las letras de ADN estándar, creando una sola mutación en cada copia de la secuencia.
Gurnett y sus colegas están aplicando esta técnica a los genes asociados con aneurismas aórticos, un debilitamiento y dilatación de la pared aórtica que puede ser fatal. A largo plazo, Gurnett prevé la creación de un catálogo que enumere los efectos de cada variante posible.La velocidad y el bajo precio de la nueva técnica hacen posible este catálogo.
"Entonces, cuando los médicos encuentran una variante que nunca antes se había visto en uno de estos genes asociados con el aneurisma aórtico, pueden revisar este catálogo y decir: 'Sí, esta mutación tiene un efecto negativo en esa proteína, por lo que esprobablemente dañino ", dijo Gurnett." Les ayudaría a decidir qué decirle al paciente. Esta sería una pieza del gran rompecabezas de interpretación para las mutaciones genéticas ".
Fuente de la historia :
Materiales proporcionado por Universidad de Washington en St. Louis . Original escrito por Tamara Bhandari. Nota: El contenido puede ser editado por estilo y longitud.
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