Tras el anuncio de enero de 2016 de la producción de un conjunto de genoma completo para el trigo harinero, el Consorcio Internacional de Secuenciación del Genoma del Trigo IWGSC, después de haber completado el control de calidad, ahora pone a disposición de los investigadores este recurso innovador a través del repositorio de secuencias de trigo IWGSC enURGI-INRA-Versailles, Francia.
Los mejoradores de trigo y los científicos de todo el mundo podrán descargar y utilizar este nuevo recurso invaluable para acelerar los programas de mejora de cultivos y la investigación de la genómica del trigo. El conjunto de datos facilitará la identificación de genes asociados con rasgos agrícolas importantes, como el aumento del rendimiento, la respuesta al estrés, y la resistencia a enfermedades y, en última instancia, harán posible la producción de variedades mejoradas de trigo para los agricultores.
Desde el anuncio de enero, el equipo del proyecto IWGSC ha estado ajustando los datos para que el ensamblaje del genoma lanzado a la comunidad científica sea de la mejor calidad posible. El recurso lanzado hoy - basado en datos de secuenciación Illumina reunidos con DeNovoMAGIC de NRGene TM el software representa con precisión más del 90 por ciento del genoma altamente complejo del trigo harinero, contiene más del 97 por ciento de los genes conocidos y asigna los datos a los 21 cromosomas del trigo.
Esta publicación de datos representa el esfuerzo continuo de IWGSC para producir una "secuencia de referencia estándar de oro": el mapa completo de todo el genoma que coloca con precisión todos los genes y otras estructuras genómicas a lo largo de los 21 cromosomas del trigo. El genoma del trigo es grande -cinco veces mayor que el genoma humano, y complejo, con tres conjuntos de siete cromosomas.
"La política de IWGSC siempre ha sido hacer que todos los datos estén disponibles públicamente tan pronto como hayan pasado los controles de calidad", explicó la directora ejecutiva de IWGSC Kellye Eversole. "Al hacerlo, la comunidad científica puede comenzar a explotar los datos ahora mientras el Consorcioavanza hacia una secuencia de referencia estándar de oro, que se lanzará en 2017. "
Como es habitual en la comunidad científica, el conjunto de datos se pone a disposición para la cría y la investigación en virtud de la "Declaración de Toronto", que describe las reglas para el intercambio de datos de prepublicación, según el cual el IWGSC se reserva el derecho de publicar los primeros análisis de los datos, que incluye descripciones de cromosomas completos o análisis a nivel del genoma de genes, familias de genes, elementos repetitivos y comparaciones con otros organismos. La información detallada sobre cómo acceder a los datos está disponible en el sitio web de IWGSC.
En los próximos meses, el equipo del proyecto IWGSC continuará su trabajo para completar una secuencia ordenada de alta calidad del genoma del trigo que incluye anotar e identificar las ubicaciones precisas de genes, elementos reguladores y marcadores a lo largo de los cromosomas, proporcionando así un valor incalculableherramientas para los mejoradores de trigo. El resultado final integrará todos los recursos genómicos producidos bajo el paraguas del IWGSC durante la última década, incluidos los mapas físicos y genéticos individuales.
El trigo es el alimento básico para más de un tercio de la población humana mundial y representa el 20% de todas las calorías consumidas en el mundo. A medida que la población mundial crece, también lo hace su dependencia del trigo. Para satisfacer las demandas futuras de unPara una población mundial proyectada de 9.600 millones para 2050, la productividad del trigo debe aumentar en un 1,6% cada año.en lugar de comprometer nuevas tierras para el cultivo. En cuanto a otros cultivos principales, una secuencia de genoma de referencia bien anotada será un recurso invaluable para este objetivo al proporcionar mapas detallados de genes y redes de genes que pueden mejorarse a través de la reproducción.
Fuente de la historia :
Materiales proporcionado por Consorcio Internacional de Secuenciación del Genoma del Trigo IWGSC . Nota: El contenido puede ser editado por estilo y longitud.
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