Los retrovirus han colonizado huéspedes vertebrados durante millones de años insertando sus genes en los genomas del huésped, lo que permite su herencia a través de generaciones como retrovirus endógenos ERV. Los investigadores de la Universidad de Uppsala ahora brindan nuevos conocimientos sobre las asociaciones a largo plazo de los retrovirus y sus anfitriones.estudiando la variación y la segregación de ERV en poblaciones de conejos salvajes y domésticos. Los hallazgos se publican en Actas de la Academia Nacional de Ciencias PNAS.
Los retrovirus, como el VIH en humanos, deben formar parte del ADN nuclear de la célula huésped para producir nuevos virus. Durante escalas temporales de millones de años, la descendencia del huésped ha heredado las infiltraciones retrovirales de las células germinales como ERV, que son grandespartes de genomas de vertebrados hoy.
Los investigadores utilizaron avances tecnológicos recientes para análisis poblacionales de genomas enteros derivados de huéspedes salvajes y domésticos, que ofrecen nuevos conocimientos sobre la variación del genoma del huésped ERV. Como modelo, los investigadores estudiaron conejos europeos, que divergieron en dos subespecies enla península ibérica hace aproximadamente un millón de años y se domesticaron en el sur de Francia hace unos 1.000 años.
"Al estudiar secuencias completas del genoma de poblaciones de huéspedes relacionadas en comparación con el genoma de un solo individuo, podemos identificar nuevos ERV para comprender mejor la coevolución retrovirus-huésped", dice Daniel Rivas, autor principal del estudio.
Utilizando datos de cientos de individuos de muchas poblaciones de conejos, los investigadores pudieron identificar inserciones retrovirales previamente desconocidas, así como determinar la propagación de las que existían en el genoma de referencia. La diversidad de ERV sigue principalmente la divergencia del conejo y los resultados indicanvariación sustancial a través de las inserciones de ERV en diferentes poblaciones de conejos. Este nuevo conocimiento arroja luz sobre cómo los ERV se propagan en las poblaciones anfitrionas, y cómo esa propagación se correlaciona con la evolución de las especies hospedadoras.
"La abundancia y la variación segregadora que descubrimos de las poblaciones anfitrionas demuestran que el registro genómico de ERV es una fuente notable de una perspectiva evolutiva sobre las asociaciones de retrovirus-huésped", dice Patric Jern, quien dirigió el estudio.
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