El acceso al ADN envuelto en unidades básicas de empaquetamiento, llamadas nucleosomas, depende de la secuencia subyacente de bloques de construcción de ADN o pares de bases. Al igual que los regalos de Navidad, algunos nucleosomas son más fáciles de desenvolver que otros. Esto se debe a que lo que hace que la doble hélice sea más rígidao más suave, recta o doblada, en otras palabras, lo que determina su elasticidad es la secuencia real de pares de bases. En un nuevo estudio publicado en EPJ E, Jamie Culkin de la Universidad de Leiden, Países Bajos, y sus colegas demuestran el papel deSecuencia de ADN que hace posible que el ADN empaquetado se abra y permita que los genes sean leídos y expresados.
En 1995, el fallecido bioquímico Jonathan Widom, de la Universidad Northwestern, Illinois, EE. UU., Demostró que los nucleosomas 'respiran' por un corto tiempo, ya que el ADN se desenvuelve parcialmente del cilindro de proteínas. Esto se debe a las fluctuaciones relacionadas con los cambios de temperaturaEste experimento pasado midió con bastante precisión la accesibilidad relativa de diferentes partes del carrete de ADN para las enzimas que cortan ese ADN.
Siguiendo sus pasos, los autores desarrollaron un modelo que utiliza simulaciones por computadora y se basa en su propio modelo de nucleosoma de grano grueso publicado anteriormente. El trabajo anterior postuló la existencia de una segunda capa de información en las moléculas de ADN, una que esde naturaleza mecánica. Por el contrario, en este estudio, utilizando el modelo de nucleosoma con elasticidad de ADN dependiente de secuencia, los autores estudiaron el efecto de la secuencia de pares de bases en la accesibilidad del nucleosoma para una lectura de genes. Su enfoque proporciona una explicación detallada decómo la nanomecánica del ADN subyacente dicta las propiedades físicas del nucleosoma.
Por cierto, el modelo también podría usarse para interpretar nuevos estudios relacionados con la tecnología de edición de genes CRISPR, que se aplica al ADN envuelto en nucleosomas y se basa en bacterias que actúan como un sistema inmune que detecta y destruye el ADN extraño.
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