Un grupo de científicos de UNSW Sydney, la Universidad de Sydney, la Universidad de Deakin, Portugal y Brasil han descubierto el ADN del sapo de caña, un anfibio venenoso que es una amenaza para muchas especies nativas de Australia. Los hallazgos fueron publicados en una revista académica GigaScience hoy.
"A pesar de su estatus icónico, existen grandes lagunas en nuestra comprensión de la genética del sapo de caña, y hasta ahora, nadie había reunido el genoma", dice Peter White, líder del proyecto y profesor de Microbiología y Biología Molecular en UNSW.
Hace una década, los investigadores en WA ya habían intentado secuenciar el genoma del sapo de caña, pero encontraron obstáculos a la hora de ensamblarlo y no completaron el proyecto.
Para este proyecto, el equipo de la UNSW-Universidad de Sydney trabajó en el Centro Ramaciotti de Genómica de la UNSW, que ha desempeñado un papel en la decodificación de los genomas de otras especies australianas icónicas, incluido el koala.
"Secuenciar y ensamblar un genoma es un proceso complicado. Al utilizar la tecnología de secuenciación de vanguardia y la experiencia disponible en la UNSW, secuenciamos 360 mil millones de pares de bases y ensamblamos uno de los genomas de anfibios de mejor calidad hasta la fecha", dice SeniorDr. Rich Edwards, autor principal del estudio.
"Logramos descifrar más del 90% de los genes del sapo de caña utilizando tecnología que puede secuenciar piezas muy largas de ADN, lo que facilita mucho la tarea de armar el rompecabezas del genoma".
Tener un borrador del genoma del sapo de caña ayudará a cerrar las brechas de conocimiento clave y acelerar la investigación del sapo de caña. Ahora se pueden secuenciar más sapos a una fracción del costo, y el genoma está disponible gratuitamente; cualquiera puede acceder a él ahora y realizar másinvestigación.
"El análisis futuro del genoma proporcionará información sobre la evolución del sapo de caña y enriquecerá nuestra comprensión de su interacción con el ecosistema en general; nos ayudará a comprender cómo se propaga el sapo, cómo funciona su toxina y brindará nuevas vías para probarpara controlar su población ", dice el experto en sapos de caña y profesor emérito Rick Shine de la Universidad de Sydney.
"Hasta la fecha se han secuenciado muy pocos genomas de anfibios, por lo que esta también es una gran noticia para los anfibios. Tener un genoma de referencia podría proporcionar información valiosa sobre cómo evolucionan las especies invasoras para adaptarse a nuevos entornos".
Tener el genoma también ayudará a los investigadores a encontrar nuevas opciones para controlar la población de sapos.
"Las medidas actuales como la remoción física no han tenido éxito, pero los nuevos métodos para enseñar a las especies nativas a no comerse el sapo, llamados aversión al sabor, brindan nuevas esperanzas. Sin embargo, necesitamos más enfoques para controlar esta especie invasora".Dice el profesor White.
Para una de esas medidas alternativas, el control biológico, es decir, el uso de un virus para ayudar a controlar la población de sapos, el material genético del sapo es esencial.
"Para encontrar un virus para el control biológico, necesitamos acceso al ADN y ARN del sapo", explica Alice Russo, estudiante de doctorado en la UNSW que se especializa en encontrar posibles virus para controlar al sapo.
"El ADN contiene fragmentos antiguos de virus; el ADN de cada animal a veces puede catalogar infecciones pasadas".
Los virus se han utilizado anteriormente con éxito para controlar la población de conejos europeos. El problema con los virus del sapo de caña estudiados hasta ahora era que podían infectar a los anfibios nativos, por lo que este estudio tuvo como objetivo encontrar un virus específico del sapo de caña.
En un artículo publicado este mes en Revista de Virología , los investigadores describen cómo tomaron muestras de sapos de caña de diferentes lugares australianos y, utilizando una combinación de secuenciación de ADN y ARN, encontraron tres nuevos virus.
"Hasta que publicamos este artículo, se sabía que solo una familia de virus afectaba al sapo de la caña. Este es el primer artículo que ha encontrado diferentes virus, lo cual es muy prometedor", dice Russo.
"Este artículo ha abierto la puerta: encontramos un retrovirus, un picornavirus y un circovirus que son genéticamente similares a los virus que infectan a las ranas, los reptiles y los peces. Para dos de ellos, encontramos un genoma completo; ambos podrían potencialmente usarsecomo agentes de biocontrol. "
Conocer estas nuevas secuencias virales ayudará a informar estudios futuros que investigarán su prevalencia y potencial como agentes para el control biológico.
"Hay mucho más trabajo por hacer. Sin embargo, estos dos artículos son los primeros, pero los más importantes, pasos para encontrar una forma eficaz de controlar al sapo de caña", concluye el profesor White.
Los sapos de caña son altamente adaptables y tienen impactos destructivos sobre la fauna nativa en las regiones invadidas, de las cuales hay muchas; están presentes en 138 países. Desde que el sapo se introdujo en Queensland para el control del escarabajo de la caña en 1935, se ha extendidoampliamente: millones de sapos ocupan ahora más de 1.2 millones de kilómetros cuadrados. Envenena fatalmente especies nativas como el quoll del norte, cocodrilos de agua dulce y varias especies de lagartos y serpientes nativas.
Fuente de la historia :
Materiales proporcionado por Universidad de Nueva Gales del Sur . Original escrito por Isabelle Dubach. Nota: el contenido se puede editar por estilo y longitud.
Referencia de la revista :
cite esta página :