En un estudio publicado en PLOS UNO , los investigadores describen dos tipos de microsatélites GGAA y su papel en la unión de EWS / FLI y la regulación génica en el sarcoma de Ewing. El sarcoma de Ewing es la segunda neoplasia ósea pediátrica más común. Se inicia por la translocación cromosómica t 11; 22 q24; q12, que crea la proteína de fusión y el controlador oncogénico EWS / FLI.
"El trabajo para comprender las sutilezas de cómo interactúan los microsatélites EWS / FLI y GGAA para impulsar la oncogénesis es fundamental para nuestra capacidad de desarrollar nuevas terapias contra los cánceres impulsados por el factor de transcripción", dice Stephen Lessnick, MD, PhD, director deel Centro para el Cáncer Infantil y las Enfermedades de la Sangre de Nationwide Children's y autor principal de la publicación. "Aquí, buscamos definir los microsatélites GGAA en un contexto de sarcoma de Ewing y comprender su papel en todo el genoma".
En su trabajo, el Dr. Lessnick y su equipo utilizaron el análisis bioinformático de datos experimentales en un enfoque imparcial de todo el genoma. Luego, vincularon computacionalmente microsatélites unidos a genes adyacentes regulados por EWS / FLI. Estos datos revelaron dos tipos distintos de GGAA-microsatélites: "tipo promotor" de corto alcance y "tipo potenciador" de largo alcance.
Según el estudio, la unión de EWS / FLI y la activación génica en microsatélites tipo promotor depende en gran medida de la longitud de los motivos GGAA.
A largo plazo, los microsatélites de tipo potenciador demuestran la unión EWS / FLI dependiente de la longitud, pero los investigadores encontraron una correlación mínima para la activación y ninguna para los objetivos reprimidos. Aquí, el número de motivos GGAA se correlaciona positivamente con la unión EWS / FLI, perono con expresión génica
La investigación adicional sobre cómo EWS / FLI se asocia con los microsatélites GGAA para impulsar la transcripción fue el tema de un estudio reciente publicado en Proceedings of the National Academy of Sciences. Ambos estudios destacan la importancia de la longitud de microsatélites en la función oncogénica.
"La longitud y ubicación del microsatélite parece ser esencial para que EWS / FLI active los objetivos de genes oncogénicos", dice el Dr. Lessnick. "Nuestros resultados han revelado y caracterizado dos clases de microsatélites GGAA que sugieren interacciones únicas y mecanismos reguladores distintos paraactivación y represión dependientes de la distancia. Esta caracterización aporta información sobre la biología del factor de transcripción EWS / FLI y aclara el papel de los microsatélites GGAA a escala genómica global ".
Fuente de la historia :
Materiales proporcionados por Hospital Nacional de Niños . Nota: El contenido puede ser editado por estilo y longitud.
Referencia del diario :
Cita esta página :