En un estudio de 124 pacientes con cánceres avanzados de mama, pulmón y próstata, un nuevo enfoque de secuenciación genómica de alta intensidad detectó ADN tumoral circulante a una tasa alta. En el 89% de los pacientes, al menos un cambio genético detectado en elel tumor también se detectó en la sangre. En general, 627 73% cambios genéticos encontrados en muestras de tumor también se encontraron en muestras de sangre con este enfoque.
El estudio se presentará en una conferencia de prensa y se presentará en la Reunión Anual de la Sociedad Americana de Oncología Clínica ASCO de 2017.
Este enfoque innovador, que utiliza secuenciación de alta intensidad para detectar el cáncer del ADN tumoral circulante en el torrente sanguíneo, anuncia el desarrollo de futuras pruebas para la detección temprana del cáncer.
El enfoque de secuenciación de alta intensidad utilizado en este estudio tiene una combinación única de amplitud y profundidad. Analiza un área muy amplia del genoma 508 genes y más de dos millones de pares de bases o letras del genoma, es decir, A, T, C y G con alta precisión cada región del genoma se secuencia o "lee" 60,000 veces, produciendo aproximadamente 100 veces más datos que otros enfoques de secuenciación. Esta enorme cantidad de datos será instrumental en el desarrollo de un análisis de sangre paradetectar el cáncer temprano.
Este enfoque, sin embargo, difiere de las biopsias líquidas, incluidas las pruebas comerciales, que solo muestran una porción relativamente pequeña del genoma en pacientes ya diagnosticados con cáncer con el fin de ayudar a controlar la enfermedad o detectar alteraciones accionables que pueden ser compatiblesmedicamentos o ensayos clínicos.
"Nuestros hallazgos muestran que la secuenciación de ADN tumoral circulante de alta intensidad es posible y puede proporcionar información invaluable para la toma de decisiones clínicas, potencialmente sin necesidad de muestras de tejido tumoral", dijo el autor principal del estudio, Pedram Razavi, MD, PhD, un médicooncólogo e instructor de medicina en el Centro de Cáncer Memorial Sloan Kettering MSK en Nueva York, NY. "Este estudio también es un paso importante en el proceso de desarrollo de análisis de sangre para la detección temprana del cáncer".
ADN tumoral circulante es un término utilizado para describir las pequeñas piezas de material genético que las células cancerosas que mueren se vierten en la circulación sanguínea. Para crear una imagen de todo el paisaje genómico del tumor a partir del ADN tumoral circulante, los científicos "leen" cada pequeñofragmente y luego júntelos como un rompecabezas. En el torrente sanguíneo, el ADN tumoral circulante es solo un pequeño subconjunto del ADN libre de células, ya que la mayoría de los fragmentos circulantes de material genético provienen de células normales.
Sobre el estudio
Los investigadores recolectaron prospectivamente muestras de sangre y tejidos de 161 pacientes con cáncer de mama metastásico, cáncer de pulmón de células no pequeñas CPCNP o cáncer de próstata resistente a la castración. Treinta y siete pacientes fueron excluidos debido a la falta de disponibilidad de los resultados deanálisis genético del tumor o muestras de ADN sin células. Para 124 pacientes evaluables para el análisis de concordancia, los investigadores compararon los cambios genéticos en los tumores con los del ADN tumoral circulante de las muestras de sangre.
Los tejidos tumorales se analizaron usando MSK-IMPACT ™, una prueba de diagnóstico de 410 genes que proporciona información genética detallada sobre el cáncer de un paciente. En cada muestra de sangre, los investigadores separaron el plasma, la parte líquida de la sangre, de las células sanguíneasEl ADN libre de células extraído del plasma y, por separado, el genoma de los glóbulos blancos se secuenciaron utilizando el ensayo de secuenciación de 508 genes de alta intensidad.
"Encontrar ADN tumoral en la sangre es como buscar una aguja en un pajar. Por cada 100 fragmentos de ADN, solo uno puede provenir del tumor y el resto puede provenir de células normales, principalmente células de médula ósea", dijo el Dr.. Razavi. "Nuestro análisis combinado de ADN libre de células y ADN de glóbulos blancos permite la identificación de ADN tumoral con una sensibilidad mucho mayor, y la secuenciación profunda también nos ayuda a encontrar esos fragmentos raros de ADN tumoral".
Los tumores de los pacientes pueden tener varios cambios genéticos; puede haber diferentes cambios en diferentes partes del mismo tumor, así como en diferentes sitios donde el tumor se disemina en el cuerpo. Por estas razones, la secuenciación sobre regiones muy amplias del genomaEs de vital importancia identificar la multitud y la diversidad de los cambios genéticos en el tumor.
Resultados clave
En el 89% de las pacientes, al menos un cambio genético detectado en el tumor también se detectó en la sangre 97% en pacientes con cáncer de mama metastásico, 85% en aquellas con NSCLC y 84% en aquellas con cáncer de próstata metastásico.En general, incluyendo todas las variaciones genómicas presentes en la mayoría de las células tumorales clonal, si no todas, así como las presentes solo en subconjuntos de células cancerosas subclonales del tejido tumoral, los investigadores detectaron un total de 864 cambios genéticos en muestras de tejido en todo eltres tipos de tumores, y 627 73% de ellos también se encontraron en la sangre.
Importantemente, sin ningún conocimiento previo del análisis del tejido tumoral, el 76% de las mutaciones "accionables" cambios genéticos que pueden coincidir con una terapia dirigida aprobada o una que se está probando en ensayos clínicos también se detectaron en sangre"La investigación previa en el campo se ha centrado principalmente en utilizar el conocimiento de la secuenciación del tejido tumoral para identificar cambios específicos para buscar en el ADN tumoral circulante. Este enfoque nos permite detectar, con gran confianza, los cambios en el ADN tumoral circulante en una gran parte deel genoma sin información del tejido tumoral ", dijo el Dr. Razavi. Mientras circulan las pruebas de ADN tumoral dirigidas a un conjunto más pequeño de genes de cáncer ya están disponibles para su uso en la práctica de rutina para guiar la atención, cubriendo un número mucho mayor de genes de cáncer, este altode secuenciación de alta intensidad puede permitir el desarrollo de pruebas futuras para la detección temprana del cáncer.
próximos pasos
El enfoque de secuenciación de alta intensidad utilizado en este estudio es una plataforma de investigación y no está destinado a estar disponible comercialmente para los pacientes. Para comprender el rendimiento actual y el potencial de este ensayo, los investigadores primero lo probaron en cáncer avanzado, un área dondeel ADN tumoral circulante se ha caracterizado previamente.
"Este estudio informará el desarrollo de la tecnología para una prueba futura que eventualmente podría usarse como un análisis de sangre para la detección temprana del cáncer. En los pacientes que se someten a la detección del cáncer, el tejido tumoral no está disponible, y tendremos que detectar cambios en el tumor circulanteADN sin conocimiento previo de los resultados del análisis de tejidos ", dijo el Dr. Razavi.
Ventajas de la biopsia líquida
Los cambios genómicos pueden diferir entre varias áreas dentro de un tumor, así como también entre los diferentes órganos donde se diseminó el cáncer. Una prueba de ADN de tumor circulante proporciona un "informe resumido" de todos los cambios genómicos en el tumor primario y las metástasis.Por el contrario, una biopsia de tejido, que generalmente toma solo una pequeña parte del tumor, a veces pierde los cambios genéticos clave que impulsan el crecimiento del cáncer.
Otra ventaja de la biopsia líquida es su capacidad para capturar los cambios genómicos en tiempo real, lo que ayuda a guiar la planificación del tratamiento sin la necesidad de biopsias de tejido convencionales adicionales. Los cambios genómicos evolucionan a medida que el cáncer crece y se propaga. Nuevos cambios pueden conducir a la recurrencia o resistencia del cánceral tratamiento. Una prueba de biopsia líquida requiere solo una simple extracción de sangre. En general, es seguro y conveniente repetir, lo que permite a los médicos realizar un seguimiento más fácil de las nuevas mutaciones.
Fuente de la historia :
Materiales proporcionado por Sociedad Americana de Oncología Clínica ASCO . Nota: El contenido puede ser editado por estilo y longitud.
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