Una nueva prueba detecta prácticamente cualquier virus que infecta a personas y animales, según una investigación de la Facultad de Medicina de la Universidad de Washington en St. Louis, donde se desarrolló la tecnología.
Se sabe que muchos miles de virus causan enfermedades en personas y animales, y hacer un diagnóstico puede ser un ejercicio exhaustivo, que a veces requiere una batería de pruebas diferentes. Esto se debe a que las pruebas actuales no son lo suficientemente sensibles como para detectar niveles bajos de viruserrores o se limitan a detectar solo aquellos virus sospechosos de ser responsables de la enfermedad de un paciente.
"Con esta prueba, no tiene que saber lo que está buscando", dijo el autor principal del estudio, Gregory Storch, MD, profesor de pediatría de Ruth L. Siteman. "Lanza una red amplia y puededetectar eficientemente los virus que están presentes en niveles muy bajos. Creemos que la prueba será especialmente útil en situaciones en las que el diagnóstico sigue siendo difícil de alcanzar después de las pruebas estándar o en situaciones en las que se desconoce la causa de un brote de enfermedad ".
Resultados publicados en línea en septiembre en la revista Investigación del genoma demuestre que en las muestras de pacientes, la nueva prueba, llamada ViroCap, puede detectar virus que no se encuentran mediante pruebas estándar basadas en la secuenciación del genoma. La nueva prueba podría usarse para detectar brotes de virus mortales como el Ébola, Marburg y las enfermedades respiratorias agudas gravessíndrome SARS, así como virus más rutinarios, incluidos rotavirus y norovirus, que causan infecciones gastrointestinales graves.
La prueba secuencia y detecta virus en muestras de pacientes y es tan sensible como los ensayos de reacción en cadena de la polimerasa estándar de oro PCR, que se utilizan ampliamente en laboratorios clínicos. Sin embargo, incluso los ensayos de PCR más expansivos solo pueden detectara unos 20 virus similares al mismo tiempo.
Los investigadores de la Universidad de Washington están poniendo la tecnología que desarrollaron a disposición del público para científicos y médicos de todo el mundo, en beneficio de los pacientes y la investigación.
Los investigadores evaluaron la nueva prueba en dos conjuntos de muestras biológicas, por ejemplo, de sangre, heces y secreciones nasales, de pacientes del St. Louis Children's Hospital. En la primera, se detectaron pruebas estándar que se basaban en la secuenciación del genomavirus en 10 de 14 pacientes. Pero la nueva prueba encontró virus en los cuatro niños que las pruebas anteriores habían pasado por alto. Las pruebas estándar no detectaron virus comunes y cotidianos: influenza B, una causa de gripe estacional; parechovirus, un virus gastrointestinal y respiratorio leve; virus del herpes 1, responsable del herpes labial en la boca; y el virus varicela-zoster, que causa la varicela.
En un segundo grupo de niños con fiebres inexplicables, las pruebas estándar detectaron 11 virus en los ocho niños evaluados. Pero la nueva prueba encontró otros siete, incluido un virus respiratorio llamado adenovirus humano B tipo 3A, que generalmente es inofensivo pero puede causarinfecciones graves en algunos pacientes.
En total, el número de virus detectados en los dos grupos de pacientes aumentó de 32 a 32, un aumento del 52 por ciento.
"La prueba es tan sensible que también detecta cepas variantes de virus que están estrechamente relacionadas genéticamente", dijo el autor correspondiente Todd Wylie, un instructor de pediatría. "Las variaciones genéticas leves entre los virus a menudo no se pueden distinguir por las pruebas disponibles en la actualidady complicar la capacidad de los médicos para detectar todas las variantes con una sola prueba "
Además, debido a que la prueba incluye información genética detallada sobre varias cepas de virus particulares, los subtipos se pueden identificar fácilmente. Por ejemplo, el estudio mostró que mientras que las pruebas estándar identificaron un virus como influenza A, que causa gripe estacional, la nueva pruebaindicó que el virus era un subtipo particularmente duro llamado H3N2.
La última temporada de gripe, el H3N2 contribuyó a unas 36,000 muertes en los Estados Unidos. Y en algunos pacientes, particularmente niños pequeños, adultos mayores y personas con sistemas inmunes debilitados, saber que la cepa H3N2 está presente puede alterar el tratamiento.
Para desarrollar la prueba, los investigadores apuntaron a extensiones únicas de ADN o ARN de cada grupo conocido de virus que infecta a humanos y animales. En total, el equipo de investigación incluyó 2 millones de extensiones únicas de material genético de virus en la prueba. Estas extensionesde material se utiliza como sondas para extraer virus en muestras de pacientes que coinciden genéticamente. El material viral compatible se analiza luego usando secuenciación genética de alto rendimiento. A medida que se descubren virus completamente nuevos, su material genético podría agregarse fácilmente a la prueba, Dijo Storch.
Los investigadores planean realizar investigaciones adicionales para validar la precisión de la prueba, por lo que podrían pasar varios años antes de que esté clínicamente disponible.
"También es posible modificar la prueba para que pueda usarse para detectar agentes patógenos distintos de los virus, incluidas bacterias, hongos y otros microbios, así como genes que indiquen que el agente patógeno es resistente al tratamiento con antibióticos u otrosmedicamentos ", dijo la coautora Kristine Wylie, PhD, profesora asistente de pediatría.
Mientras tanto, los científicos pueden utilizar la tecnología para estudiar los virus en un entorno de investigación. Kristine Wylie investiga los virus que establecen su residencia en el cuerpo humano, conocido colectivamente como el viroma. La nueva prueba proporcionará una manerapara capturar toda la amplitud y profundidad de dichos virus y profundizar la comprensión de cómo juegan un papel en mantener el cuerpo sano.
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Materiales proporcionado por Facultad de medicina de la Universidad de Washington . Nota: El contenido puede ser editado por estilo y longitud.
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