Como la nueva tecnología permite a los investigadores sumergirse más profundamente en el genoma y el exoma, una nueva clase de ARN llamada ARN circular puede desempeñar un papel intrigante.
Investigadores del Centro de Cáncer Rogel de la Universidad de Michigan han catalogado el ARN circular en múltiples cánceres y realizaron una investigación inicial que sugiere que estas estructuras estables podrían servir como biomarcadores de cáncer en sangre u orina.
El ARN circular es un tipo de ARN no codificante que se forma en una estructura circular cerrada en lugar de una estructura lineal. Los nuevos métodos de secuenciación del ARN los han sacado a la luz, y se sabe poco sobre por qué o cómo funcionan. Pero su estructura establelos hace candidatos ideales para desarrollar biomarcadores de cáncer.
El estudio, publicado en Celda , identifica un compendio de circRNA en cáncer, creando una base de datos para futuros estudios.
"Estoy muy entusiasmado con el potencial de los ARN circulares como biomarcadores no invasivos. Debido a su estabilidad, podríamos detectarlos en la sangre o la orina de pacientes con cáncer. Esto podría ser útil para el diagnóstico o pronóstico del cáncer,"dice Arul M. Chinnaiyan, MD, Ph.D., director del Centro de Patología Traslacional de Michigan y Profesor de Patología SP Hicks en Medicina de Michigan.
Los investigadores identificaron circRNA de más de 800 muestras de tumor recolectadas como parte del programa MiONCOSEQ. Demostraron que la secuencia de captura de ARN desarrollada para MiONCOSEQ fue más robusta en la detección de circRNA que los métodos existentes.
"El enfoque de captura puede ser limitado porque se basa en las sondas que utilizamos para capturar ARN. Pero todo el enfoque de captura de exoma lo hace significativo. Capturamos una gran franja de ARN de esa manera. Es por eso que pudimos nominar a tantoscircRNA que no se conocían antes ", dice Chinnaiyan.
La técnica requiere solo una pequeña cantidad de ARN total para poder identificar circRNA. Esto significa que podría detectarse en lugares donde el ARN está diluido, como sangre u orina.
Además, el equipo identificó varios circRNA que se encontraron en el tejido de cáncer de próstata. Al evaluar el circRNA de las células de cáncer de próstata, descubrieron que eran más estables que el ARN lineal. También se podían detectar en muestras de orina.
"Pudimos demostrar que estos circRNA existen en la orina y que los que provienen del cáncer de próstata pueden detectarse. Nuestros futuros estudios explorarán estos circRNA como biomarcadores de cáncer a base de orina o sangre", dice Chinnaiyan.
Los investigadores convirtieron sus hallazgos en una base de datos llamada MiOncoCirc, catalogando los circRNA informados a partir de muestras de tumores. Este recurso está disponible para que otros investigadores ayuden a desarrollar nuevos biomarcadores de cáncer.
Autores adicionales: Josh N. Vo, Marcin Cieslik, Yajia Zhang, Sudhanshu Shukla, Lanbo Xiao, Yuping Zhang, Yi-Mi Wu, Saravana M. Dhanasekaran, Carl G. Engelke, Xuhong Cao, Dan R. Robinson, Alexey INesvizhskii
Financiación: el Instituto Nacional del Cáncer otorga U01 CA214170, P50 CA186786, P50 CA097186, U24 CA210967; Fundación del Cáncer de Próstata; Departamento de Defensa otorga PC160429, W81XWH-17-1-0134, W81XWH-16-1-0195. Chinnaiyan es un HowardHughes Medical Institute Investigador, Taubman Scholar y American Cancer Society Professor.
Fuente de la historia :
Materiales proporcionado por Medicina de Michigan - Universidad de Michigan . Original escrito por Nicole Fawcett. Nota: El contenido puede ser editado por estilo y longitud.
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