El científico de IMBA desarrolló un biobanco de células madre embrionarias mutantes y reversibles, publicado en la edición actual de Nature. Este banco de células, llamado Haplobank, contiene más de 100,000 líneas de células madre embrionarias de ratón mutantes y condicionales, dirigidas a aproximadamente el 70% deEl genoma codificador de proteínas.
Los exámenes genéticos han revolucionado nuestra comprensión de los procesos biológicos y los mecanismos de la enfermedad. Los avances técnicos recientes han ampliado los enfoques disponibles para interrumpir la función genética en una población celular antes del examen, desde la mutagénesis química e insercional hasta la interferencia de ARN y, más recientemente, CRISPRSin embargo, la mayoría de los enfoques de mutagénesis no son reversibles, lo que dificulta el control riguroso de las frecuentes diferencias genéticas y epigenéticas.entre células aparentemente idénticas. Estos problemas pueden confundir la reproducibilidad, la interpretación y el éxito general de las pantallas genéticas.
En los últimos años han surgido importantes preocupaciones sobre la reproducibilidad científica y el rigor. Amgen y Bayer, así como The Reproducibility Initiative, no han podido replicar muchos estudios de cáncer de alto perfil. De hecho, no es raro obtener resultados diferentes de los experimentoscon la misma línea celular en dos laboratorios diferentes. Estas inconsistencias pueden surgir por varias razones. Independientemente, los resultados irreproducibles desperdician dinero, dañan la credibilidad de la ciencia y los científicos y retrasan o deshacen el progreso, incluido el desarrollo de terapias efectivas.
Para superar estos problemas, el laboratorio de Penninger en el IMBA desarrolló un biobanco de células madre embrionarias mutantes y reversibles, publicado en la edición actual de Nature. Este banco de células, llamado Haplobank, contiene más de 100,000 células madre embrionarias de ratón condicionadas y mutadas.líneas celulares, dirigidas a cerca del 70% del genoma codificador de proteínas casi 17,000 genes ". Haplobank está disponible para todos los científicos y representa la biblioteca más grande hasta la fecha de líneas de células madre embrionarias mutantes hemiziogo hasta la fecha. El recurso supera los problemas derivados de la clonaciónvariabilidad, porque las mutaciones pueden repararse en células individuales y a escala del genoma completo ", explica Ulrich Elling, primer autor y autor correspondiente de la publicación actual en Nature.
interacciones huésped-patógeno y descubrimiento de fármacos
Como prueba de principio, los autores realizaron un examen genético para descubrir los factores necesarios para la infección por rinovirus, la causa del resfriado común. Descubrieron que el rinovirus requiere un factor de células huésped previamente desconocido, la fosfolipasa A2G16 PLA2G16, para matar células. Además, mostraron que se requiere un dominio específico de PLA2G16 para la infección y que puede ser un objetivo farmacológico atractivo. Curiosamente, también se demostró recientemente que PLA2G16 es necesario para una infección exitosa por virus relacionados, incluido el poliovirus.
Nuevos genes para el desarrollo de vasos sanguíneos
En otra prueba de prueba de principio, los autores aprovecharon el potencial pluripotente de las células madre embrionarias al diferenciarlas en organoides de los vasos sanguíneos. La formación de vasos sanguíneos angiogénesis es crítica para el desarrollo y el mantenimiento de los tejidos, así como paraenfermedades como el cáncer. Los autores examinaron los genes candidatos de angiogénesis que estaban representados en Haplobank y descubrieron múltiples factores novedosos que afectan el crecimiento de los vasos sanguíneos en los organoides. Importantemente, observaron una fuerte variabilidad entre clones independientes, destacando la ventaja de la mutagénesis reparable para comparar mutantes consus clones hermanos genéticamente reparados.
"Haplobank se puede usar para pantallas para obtener información completamente nueva sobre la biología y la salud. Es importante, porque los genes eliminados pueden repararse en nuestros clones de tallo embrionario, este recurso también permite experimentos de validación bien controlados, robustos y reproducibles. NosotrosSiento que este es un punto crítico y una contribución, dados los esfuerzos actuales para mejorar el rigor de la investigación científica ", dice Josef Penninger, Director de IMBA y último autor.
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Materiales proporcionado por Instituto de Biotecnología Molecular IMBA . Nota: El contenido puede ser editado por estilo y longitud.
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