Para casi mil millones de personas en todo el mundo, la yuca es un cultivo básico y una fuente primaria de calorías. La planta es fácil de cultivar, los esquejes crecen bien en tierras marginales y es muy tolerante a la sequía. Para los EE. UU.Departamento de Energía, estos rasgos y sus cualidades almidonadas hacen que la yuca sea de interés como materia prima potencial para la producción de biocombustibles.
Aunque la yuca es fácil de cultivar, es particularmente vulnerable a los patógenos de las plantas, lo que puede reducir significativamente los rendimientos de los cultivos. Para ayudar a mejorar las estrategias de mejoramiento para este cultivo de raíz, un equipo dirigido por investigadores de la Universidad de California, Berkeley e incluidos investigadores delEl DOE Joint Genome Institute JGI, una instalación de usuarios de la Oficina de Ciencia del DOE, describió la diversidad genética de la yuca en una publicación avanzada en línea del 18 de abril de 2016 Biotecnología de la naturaleza . Como las raíces de yuca contienen 20-40% de almidón que cuesta 15-30% menos producir por hectárea que el almidón de maíz, en muchas partes del mundo, particularmente África y el sudeste asiático, representa una fuente estratégica de energía renovable.-biomasa a partir de la cual se produce etanol para combustibles de transporte. Con la ayuda de la genómica, los investigadores esperan aplicar estrategias avanzadas de mejoramiento que puedan mejorar la resistencia de la mandioca a las enfermedades y mejorar el rendimiento de los cultivos.
El genoma de la yuca fue secuenciado bajo los auspicios del DOE JGI Community Science Program y Roche 454 Life Sciences. Desde que se lanzó el borrador de la secuencia en 2009, los investigadores lo han mejorado con datos adicionales para desarrollar una secuencia a escala cromosómica, enparte para aplicar la información hacia estrategias mejoradas de mejoramiento.
En el documento, el equipo, que incluía a los becarios posdoctorales de UC Berkeley Jessen Bredeson y Jessica Lyons y Simon Prochnik y Albert Wu del DOE JGI, comparó el genoma de referencia de la yuca con los genomas de los parientes ricino Ricinis communis, árbol de caucho Heveabrasiliensis, caucho de Ceará Manihot glaziovii y 53 variedades de yuca cultivadas y de tipo silvestre de todo el mundo. Descubrieron que la diversidad genética de la yuca utilizada en los esfuerzos actuales de mejoramiento se ha reducido en gran medida en África, donde virus como el mosaico de la yucaLa enfermedad y la enfermedad de la raya parda de la yuca han afectado los rendimientos de los cultivos en muchas naciones.Las variedades de yuca de élite sugieren que confieren rasgos deseables y también aclararon la relación entre muchas variedades de yuca cultivadas, que pueden ayudar a producirLos lectores maximizan la diversidad genética en los programas de mejora.
"Las variantes y la estructura de la población descritas aquí son insumos esenciales para los enfoques basados en la selección de genoma y asistidos por marcadores para mejorar la resistencia a las enfermedades y el rendimiento de este cultivo básico", anotó el equipo.
El genoma de la yuca está disponible en el fitozoma del portal de plantas DOE JGI en http://phytozome.jgi.doe.gov/ .
Steve Rounsley, de Dow AgroSciences, habló sobre la genómica de la yuca en la Reunión de Genómica de Energía y Medio Ambiente 2014 del DOE JGI. Vea el video en http://bit.ly/JGI14UMRounsley .
Fuente de la historia :
Materiales proporcionado por DOE / Instituto Conjunto del Genoma . Nota: El contenido puede ser editado por estilo y longitud.
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