Si bien se creía que los genes regulaban las funciones biológicas casi exclusivamente al transcribirse a los ARN codificadores que luego se traducían en proteínas, ahora se sabe que la imagen es mucho más compleja. De hecho, los estudios que examinan la asociación entre genes y enfermedadeshan demostrado que la mayoría de las variantes de la enfermedad se encuentran fuera de los genes que codifican proteínas.
El consorcio FANTOM liderado por RIKEN fue pionero en el descubrimiento de ARN no codificantes hace más de una década, revelando la complejidad del paisaje transcripcional en genomas de mamíferos por primera vez. El consorcio FANTOM continúa a la vanguardia de los estudios en elorígenes y funciones de los ARN no codificantes. En su último trabajo, publicado en Naturaleza , el equipo ha generado un atlas integral de ARN humanos no codificantes largos con modelos genéticos sustancialmente mejorados, lo que les permite evaluar mejor la diversidad y la funcionalidad de estos ARN. La mayoría de los intentos hoy en día para dibujar mapas de transcripción de ARN se basan en tecnologías de secuenciación queno siempre identifica con precisión los comienzos, o los extremos 5 ', de las transcripciones de ARN. Para superar esta limitación, el equipo utilizó una tecnología conocida como Análisis de Cap de Expresión Génica CAGE, que se desarrolló en RIKEN, para construir un atlas deARN largos humanos no codificantes con extremos precisos de 5 ', que indican con precisión dónde se inicia la transcripción en el genoma
El atlas, que contiene 27,919 ARN no codificantes largos, resume por primera vez sus patrones de expresión en los principales tipos de células y tejidos humanos. Al intersecar este atlas con datos genómicos y genéticos, sus resultados sugieren que 19,175 de estos ARN puedenser funcional, insinuando que podría haber tantos, o incluso más, ARN no codificantes funcionales que los aproximadamente 20,000 genes codificadores de proteínas en el genoma humano.
"Existe un fuerte debate en la comunidad científica sobre si los miles de ARN no codificantes generados a partir de nuestros genomas son funcionales o simplemente son subproductos de una ruidosa maquinaria transcripcional", dice el profesor Alistair Forrest del Instituto de Investigación Médica Harry Perkins enla Universidad de Australia Occidental y el científico visitante principal en el Centro RIKEN para Tecnologías de Ciencias de la Vida CLST, uno de los autores correspondientes del artículo, "Al integrar los modelos genéticos mejorados con datos de expresión génica, conservación evolutiva y estudios genéticos, nosotrosencontramos evidencia convincente de que la mayoría de estos ARN no codificantes largos parecen ser funcionales, y para casi 2,000 de ellos revelamos su posible participación en enfermedades y otros rasgos genéticos ".
"Curiosamente", dice Chung-Chau Hon de CLST, primer autor del artículo, "la mayoría de los ARN largos no codificantes parecen generarse a partir de elementos potenciadores. Aumenta nuestra comprensión hacia los orígenes en gran medida heterogéneos de los no largoscodificación de ARN "
Según Piero Carninci de CLST, "Los modelos genéticos mejorados y las amplias sugerencias funcionales de los ARN humanos no codificantes largos derivados de este atlas podrían servirnos como una piedra de Rosetta para que podamos investigar experimentalmente su relevancia funcional como parte de nuestro trabajo en cursopara la próxima edición del consorcio FANTOM. Anticipamos que estos resultados podrían ampliar aún más el límite de nuestra comprensión de las funciones de la porción no codificante de nuestro genoma ... "
Los recursos del largo atlas de ARN no codificante están disponibles en http://fantom.gsc.riken.jp/cat .
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Materiales proporcionados por RIKEN . Nota: El contenido puede ser editado por estilo y longitud.
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