Un nuevo marco computacional ha revelado diferencias clave entre cuatro medicamentos para la artritis reumatoide y su impacto en las vías biológicas en ratones. Niki Karagianni de Biomedcode Hellas SA, Grecia, y sus colegas presentan su nuevo enfoque y hallazgos en Biología Computacional PLOS .
Las personas con artritis reumatoide a menudo reciben medicamentos que se dirigen e inhiben el factor de necrosis tumoral TNF, una proteína involucrada en la inflamación dolorosa y dañina característica de la enfermedad.los detalles de sus diferentes efectos moleculares sobre los procesos biológicos no han sido claros.
Para llenar este vacío, Karagianni y sus colegas emplearon un modelo de ratón de poliartritis inflamatoria crónica: ratones que expresan el TNF humano y desarrollan síntomas y firmas que reflejan de cerca la forma humana de la enfermedad. Los ratones enfermos recibieron tratamiento con uno de cuatromedicamentos anti-TNF Remicade, Cimzia, Humira o Enbrel, o en comparación, ninguno de los medicamentos. Luego, los investigadores los compararon con ratones sanos.
Después del tratamiento, los investigadores recolectaron tejido articular de todos los ratones y analizaron sus transcriptomas, el conjunto completo de moléculas de ARN mensajero en los tejidos, que indica qué genes están activados o desactivados. Luego, aplicaron una serie de pasos computacionalesa los datos del transcriptoma para comparar los efectos de los cuatro fármacos diferentes.
El análisis reveló diferencias previamente desconocidas en la forma en que los cuatro fármacos afectan la expresión génica en ratones enfermos. Algunas de estas diferencias se encontraron para genes directamente involucrados en la artritis, pero muchas se encontraron en genes no relacionados con la artritis, como los genes involucradosen enfermedades cardiovasculares y otras afecciones que pueden ocurrir junto con la artritis.
"Quizás el resultado más importante de nuestro estudio es la gran cantidad de genes regulados negativamente en los animales enfermos, que están asociados con funciones y vías que hasta hace poco se pasaban por alto en gran medida", dice el coautor del estudio, Christoforos Nikolaou. "Estos podrían proporcionar información adicional sobre los mecanismos de la patología de la artritis".
El nuevo marco computacional desarrollado para este estudio podría reutilizarse para realizar comparaciones detalladas de otros fármacos en otras enfermedades. Para ayudar a facilitar esto, los investigadores están trabajando para organizar el sistema en un paquete autónomo y automatizado.
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Materiales proporcionados por PLOS . Nota: el contenido se puede editar por estilo y longitud.
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