Las técnicas moleculares avanzadas han revelado la diversidad de un grupo poco comprendido de microbios oceánicos llamados protistas, según una nueva publicación en Informes científicos . El proyecto analizó muestras recolectadas por la expedición global de Tara Oceans, documentando genomas que ayudarán a los investigadores a identificar protistas en todo el océano.
"Muchos protistas oceánicos no se pueden cultivar en el laboratorio, por lo que debemos encontrar formas de interrogarlos en su entorno", dijo Mike Sieracki, autor principal del estudio. "Cada gota de agua de mar contiene ecosistemas microbianos que conocemos muy poco sobre, y es urgentemente importante comprender este ecosistema fundamental de nuestro planeta oceánico, la Tierra, y cómo reacciona ante el cambio ".
Los protistas forman algunas de las relaciones más complejas del océano con otros miembros de la red alimentaria microbiana, incluido el parasitismo y los enfoques de alimentación que combinan la fotosíntesis y la depredación. El equipo de investigación analizó los protistas de todo el Océano Índico y el Mar Mediterráneo utilizando genómica de células individuales, un conjunto de técnicas moleculares que revela los planos genéticos de las células individuales. Esta es la primera vez que este enfoque se aplica a comunidades microbianas enteras de diferentes lugares.
Sieracki es actualmente director de programa en oceanografía biológica en la National Science Foundation. Realizó esta investigación mientras trabajaba como investigador científico en el Laboratorio Bigelow para Ciencias del Océano, donde ayudó a fundar el Centro de Genómica de Células Individuales del instituto. Los investigadores utilizaron elTecnología avanzada del centro para clasificar y analizar individualmente a los protistas, revelando un código genético que nunca antes se había identificado.
"Los protistas son los depredadores más numerosos del océano, sin embargo, todavía sabemos muy poco acerca de quiénes son y qué hacen en la naturaleza", dijo Ramunas Stepanauskas, científico investigador sénior y director del Centro de Genómica de Células Individuales. "Somoscomenzando a revelar el alcance completo de la diversidad y los roles ecológicos de estos fascinantes componentes de los ecosistemas marinos ".
Los investigadores documentaron más de 900 genomas de células individuales, a los que los científicos de todo el mundo podrán hacer referencia al identificar protistas en el futuro. Este paso crucial ayudará a los investigadores a mapear comunidades microbianas utilizando la metagenómica, una forma poderosa de analizar simultáneamente comunidades enteras.
El proyecto, financiado por la National Science Foundation, también representa un hallazgo importante y una producción significativa de la expedición de los océanos de Tara. Este viaje de navegación muestreó el océano global entre 2009 y 2013, tomando una instantánea de las comunidades microbianas que prosperan en todo el mundo ycapturando la increíble variabilidad de la vida planctónica. Sieracki y Nicole Poulton, otro autor del artículo, navegaron en la expedición como científicos principales.
"Los protistas son algunas de las próximas incógnitas en el océano abierto", dijo Poulton, científico investigador del Laboratorio Bigelow y director de la Instalación para Citometría Acuática. "Aunque son mucho menos abundantes que las bacterias, estamos descubriendo queexaminar los protistas revela mucha más complejidad dentro de los ecosistemas marinos ".
El Laboratorio Bigelow alberga las muestras recolectadas por la expedición Tara Oceans para el análisis de células individuales. Poulton espera usar las mismas técnicas para explorar protistas de otras regiones oceánicas, llenando progresivamente las lagunas en nuestro conocimiento del océano y ayudando a otros investigadores a cartografiar microbioscomunidades en mayor detalle.
"La genómica unicelular nos ha permitido capturar y comprender la biodiversidad en el océano a un nivel muy diferente al que estaba disponible anteriormente", dijo Poulton. "Estos genomas nos permitirán aprender cómo funcionan estos importantes microbios en su entorno."
Fuente de la historia :
Materiales proporcionado por Laboratorio Bigelow de Ciencias del Océano . Nota: El contenido puede ser editado por estilo y longitud.
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